典型文献
尖孢镰刀菌全基因组密码子偏好性及特征分析
文献摘要：
[目的]探究尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)全基因组的密码子使用模式,分析影响其密码子组成和编码特性的因素.[方法]以F.oxysporum全基因组数据为试验材料,利用CodonW、R等软件分析密码子偏好性及其影响因素.[结果]共得到18125条符合分析要求的序列;F.oxysporum的平均GC含量为51.46％,ENC值为24.31～61.00,且共有94.41％的ENC值大于45.亮氨酸和丙氨酸占比较高,分别为8.86％和8.29％;色氨酸和半胱氨酸占比较低,分别仅为1.61％和1.34％.F.oxysporum拥有33个高频密码子、19个最优密码子、密码子主要以G/C结尾;密码子基本参数相关性分析表明,GC1和GC2相关性极显著(P<0.01),GC3与ENC的相关性最强(P<0.01).[结论]尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)全基因组密码子偏好性主要受自然选择作用影响,同时GC3与ENC相关性最强;33个高频密码子和19个最优密码子主要以G/C结尾.
文献关键词：
尖孢镰刀菌;密码子偏好性;最优密码子;有效密码子
中图分类号：
作者姓名：
路景诗;赵远征;王东;李晓杰;彭静文;张龙梅;张晓明
作者机构：
内蒙古农业大学,内蒙古呼和浩特 010018;内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古呼和浩特 010031;内蒙古自治区农牧业技术推广中心,内蒙古呼和浩特 010011
文献出处：
引用格式：
[1]路景诗;赵远征;王东;李晓杰;彭静文;张龙梅;张晓明-.尖孢镰刀菌全基因组密码子偏好性及特征分析)[J].北方农业学报,2022(04):11-17
A类：
B类：
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AB值：
0.22585
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