典型文献
肺结节病生物标志物与治疗药物的筛选与分析
文献摘要：
目的:筛选肺结节病相关的生物标志物并进行功能分析,并预测潜在的治疗药物.方法:从基因表达数据库中下载表达谱GSE34608数据集,导入GEO2R在线工具筛选结节病患者与健康对照之间的差异表达基因(DEGs),然后采用DAVID网站对差异基因进行基因本体(GO)富集分析和通路富集分析,并基于STRING数据库建立蛋白互作网络.根据DGIdb数据库预测能够治疗结节病的潜在药物.结果:与健康对照组相比,共筛选出2837个DGEs,包括上调基因1662个,下调基因1175个.GO富集分析发现,差异基因主要参与信号传导活性、肿瘤坏死因子(TNF)结合、NF-κB信号、细胞周期阻滞、细胞黏附、免疫反应、蛋白磷酸化等生物过程.通路富集分析表明内吞,NF-κB信号,TNF信号,MAPK信号,趋化因子信号,Toll样受体信号,细胞凋亡等通路显著富集.蛋白互作网络分析挖掘出的核心基因包括TLR4、JUN、CASP3、PTEN和CXCL8.筛选出的潜在治疗结节病的药物包括紫杉醇、秋水仙素、西妥昔单抗、甲巯咪唑等.结论:本研究筛选出了肺结节病相关的候选基因和信号通路,扩展了对其病因和分子机制的理解,这些核心基因可能作为诊断标志物和药物治疗的靶点.
文献关键词：
肺结节病;差异基因;NF-κB信号通路;免疫反应;生物标志物;药物靶点
中图分类号：
作者姓名：
郭新劝;张云庆
作者机构：
洛阳新区人民医院检验科,河南 洛阳 471023
文献出处：
引用格式：
[1]郭新劝;张云庆-.肺结节病生物标志物与治疗药物的筛选与分析)[J].黑龙江医学,2022(14):1687-1690
A类：
GSE34608
B类：
肺结节病,生物标志物,治疗药物,功能分析,基因表达数据库,下载,表达谱,GEO2R,差异表达基因,DEGs,DAVID,差异基因,基因本体,通路富集分析,STRING,数据库建立,DGIdb,潜在药物,DGEs,信号传导,细胞周期阻滞,细胞黏附,免疫反应,蛋白磷酸化,生物过程,内吞,MAPK,趋化因子,Toll,样受体,蛋白互作网络分析,挖掘出,核心基因,TLR4,JUN,CASP3,PTEN,CXCL8,潜在治疗,紫杉醇,秋水仙素,西妥昔单抗,甲巯咪唑,候选基因,诊断标志物,药物靶点
AB值：
0.315028
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