典型文献
头颈部鳞状细胞癌焦亡相关lncRNA对预后风险模型的构建与评估
文献摘要：
目的 基于生物信息学方法构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)焦亡相关lncRNA对预后风险模型并进行评估.方法 从TCGA数据库中获取HNSCC的转录组数据,与焦亡相关基因进行共表达和差异分析,并以焦亡相关lncRNA对展示.将HNSCC患者随机分为训练集(246例)和验证集(245例),采用Cox回归分析和改良Lasso惩罚回归进行预后模型构建.根据训练集风险评分的中位数将HNSCC患者分为高、低风险组,并计算所有样本的风险得分,采用Kap-lan-Meier法对两组患者进行生存分析并绘制生存曲线.通过绘制ROC曲线评估模型的准确性.单因素和多因素Cox回归分析患者临床病理资料和风险评分与总生存率的关系,探索HNSCC预后危险因素.结果 在HNSCC中共提取到53个差异焦亡相关的lncRNA(FDR<0.05,logFC>2),并以lncRNA对形式进行展示.通过Cox回归分析和改良Lasso惩罚回归筛选出18个预后相关lncRNA对用于预后风险模型构建.训练集和验证集结果表明,低风险组患者生存时间高于高风险组患者(P<0.05);预后风险模型1年总生存ROC曲线下面积>0.7;单因素和多因素Cox回归分析显示风险评分是HNSCC的独立预后因素.结论 基于18个焦亡相关lncRNA对建立的预后模型可以有效预测HNSCC患者的预后情况,且风险评分是HNSCC的独立预后因素.
文献关键词：
头颈部鳞状细胞肿瘤;细胞焦亡;免疫检查点
中图分类号：
作者姓名：
罗倩;詹雪冰;况云舒;陶香香;王俊;梁箫;王俊杰;孙恩涛;陈冰
作者机构：
皖南医学院病理教研室,安徽 芜湖 241002;皖南医学院检验学院,安徽 芜湖 241002
文献出处：
引用格式：
[1]罗倩;詹雪冰;况云舒;陶香香;王俊;梁箫;王俊杰;孙恩涛;陈冰-.头颈部鳞状细胞癌焦亡相关lncRNA对预后风险模型的构建与评估)[J].右江民族医学院学报,2022(05):666-674
A类：
头颈部鳞状细胞肿瘤
B类：
头颈部鳞状细胞癌,lncRNA,预后风险模型,生物信息学方法,HNSCC,TCGA,转录组数据,焦亡相关基因,共表达,训练集,验证集,Cox,Lasso,预后模型,风险评分,中位数,低风险组,计算所,有样,Kap,lan,Meier,生存分析,生存曲线,临床病理资料,总生存率,预后危险因素,共提取,取到,FDR,logFC,集结,生存时间,高风险组,独立预后因素,预后情况,细胞焦亡,免疫检查点
AB值：
0.262567
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