典型文献
羟基红花黄色素A抗氧化作用网络药理学研究
文献摘要：
目的 运用网络药理学的方法研究羟基红花黄色素A(hydroxysafflor yellow A,HSYA)抗氧化作用机制.方法 通过PubChem数据库查寻HSYA的分子结构并下载保存SDF格式文件,利用SwissTargetPrediction数据库查找其作用靶点.以"anti-oxidation""anti oxidation"为关键词在GeneCards、OMIM数据库中搜索与抗氧化作用相关的靶点.利用Version 2.1在线平台对药物靶点和疾病靶点取交集进行匹配;采用Cytoscape 3.8.0软件构建HSYA成分-靶点-疾病(抗氧化)网络;将HSYA抗氧化作用靶点导入STRING数据库进行蛋白-蛋白相互作用分析,并将分析结果导入Cytoscape 3.8.0进行可视化处理.应用R语言对共同靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集和KEGG通路富集分析,通过Cytoscape 3.8.0软件构建HSYA成分-靶点-通路网络图.利用LeDock软件和PyMol 1.7.2.1软件对预测结果进行分子对接验证.结果 获得了31个HSYA抗氧化作用潜在靶点,关键靶点可能为PIK3CA、MTOR、IKBKB、STAT3、EGFR、JUN等靶点.GO分析结果显示,抗氧化靶点主要富集于肽-丝氨酸磷酸化、正调控活性氧代谢过程、正调控一氧化氮生物合成过程、活性氧代谢过程等生物过程;KEGG富集分析结果显示有104条通路与抗氧化相关,主要包括PI3K-Akt信号通路、NOD样受体信号通路、JAK-STAT信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制和耐药信号通路、Th17细胞分化相关通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路、EerB信号通路等信号通路.分子对接证实HSYA可与对应靶点结合,进一步验证了网络药理学预测的可靠性.结论 HSYA通过多靶点协作调控多种信号通路发挥抗氧化作用.
文献关键词：
羟基红花黄色素A;抗氧化;网络药理学;蛋白互作网络
中图分类号：
作者姓名：
陆萌;石学魁;王妍
作者机构：
牡丹江医学院病原生物学教研室,黑龙江 牡丹江 157011
文献出处：
引用格式：
[1]陆萌;石学魁;王妍-.羟基红花黄色素A抗氧化作用网络药理学研究)[J].牡丹江医学院学报,2022(06):35-40
A类：
hydroxysafflor,LeDock,EerB
B类：
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AB值：
0.326555
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