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高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析
文献摘要：
利用高通量测序技术对高山绣线菊叶片进行转录组测序,获得的转录组数据可用来进行拼接、功能注释、表达水平及差异等分析.组装拼接后获得53892条Unigenes.与多个数据库进行比对后,31627条Unigenes成功注释到NR库;16166条基因注释到KOG数据库,共有26个子类;29111条注释到GO数据库,注释基因被分为分子功能、生物学过程和细胞组分3大类;3475条注释到KEGG数据库,涉及的代谢通路可归为四大类,分别是代谢相关通路、遗传信息处理、细胞过程及环境信息处理;此外,共统计到3条与低温胁迫代谢通路相关的主要途径,21条次生代谢途径,1168条Unigenes,涉及Unigenes数量最多的通路为碳代谢、氨基酸类的生物合成等.该研究旨在筛选高山绣线菊低温胁迫相关代谢通路,挖掘关键基因,对后续其适应低温胁迫分子机制的研究具有一定指导意义.
文献关键词：
高山绣线菊;高通量测序;转录组;低温胁迫
中图分类号：
作者姓名：
韩霜;余静雅;韩赟;张发起
作者机构：
中国科学院西北高原生物研究所高原适应与进化重点实验室,青海西宁810001;中国科学院大学生命科学学院,北京100039
文献出处：
引用格式：
[1]韩霜;余静雅;韩赟;张发起-.高寒灌丛建群种高山绣线菊的低温适应转录组信息分析)[J].中国野生植物资源,2022(08):1-7,36
A类：
B类：
高寒灌丛,建群种,高山绣线菊,应转,信息分析,高通量测序技术,转录组测序,转录组数据,拼接,功能注释,Unigenes,NR,基因注释,KOG,子类,注释基因,生物学过程,代谢通路,相关通路,遗传信息,信息处理,环境信息,低温胁迫,次生代谢,代谢途径,碳代谢,氨基酸类,生物合成,关键基因
AB值：
0.305027
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