典型文献
高通量测序技术在线虫多样性研究中的应用
文献摘要：
土壤线虫多样性是土壤生态学研究的热点之一,然而对土壤线虫群落组成及多样性的研究通常受到分类学和方法学的限制.当前,分子生物学技术的快速发展丰富了我们对土壤线虫多样性的认识,但也存在一定的局限性.本文综述了常用分子生物学技术如变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)、末端限制性片段长度多态性分析(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)、实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)和高通量测序(high-throughput sequencing,HTS)技术近年来在线虫多样性研究中的应用,重点从土壤线虫DNA提取方法、引物和数据库的选择、高通量测序技术和形态学鉴定结果的比较等方面阐述了高通量测序技术在线虫多样性研究中的优势与不足,并提出选择合适的线虫DNA提取方法结合特定引物和数据库进行注释分析,仍是今后使用高通量测序技术开展线虫多样性研究的重点.当研究目标是土壤线虫多样性时,优先推荐富集线虫悬液提取DNA的方法,因此,研究人员应根据具体目标选择最优组合开展实验研究.
文献关键词：
分子生物学技术;高通量测序;土壤线虫多样性;线虫DNA提取;形态学鉴定
中图分类号：
作者姓名：
孙翌昕;李英滨;李玉辉;李冰;杜晓芳;李琪
作者机构：
中国科学院沈阳应用生态研究所土壤生态与农业生态工程研究中心,沈阳110016;中国科学院大学,北京100049
文献出处：
引用格式：
[1]孙翌昕;李英滨;李玉辉;李冰;杜晓芳;李琪-.高通量测序技术在线虫多样性研究中的应用)[J].生物多样性,2022(12):196-206
A类：
B类：
高通量测序技术,多样性研究,土壤线虫多样性,土壤生态,生态学研究,土壤线虫群落,群落组成,分类学,方法学,分子生物学技术,凝胶电泳,denaturing,gradient,gel,electrophoresis,DGGE,限制性片段长度多态性,多态性分析,terminal,restriction,fragment,length,polymorphism,RFLP,quantitative,real,qPCR,high,throughput,sequencing,HTS,引物,形态学鉴定,优势与不足,展线,具体目标,目标选择,最优组合
AB值：
0.308671
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