典型文献
高光胁迫下香果树叶片生理生化指标变化及相关基因差异表达和功能分析
文献摘要：
以光照强度54μmol·m-2·s-1为对照,对高光胁迫(光照强度180μmol·m-2·s-1)下香果树(Emmenopterys henryi Oliv.)幼苗叶片的部分生理生化指标变化进行分析;采用RNA-seq技术筛选高光胁迫下的差异表达基因,并对其进行功能和表达分析及qRT-PCR验证.结果表明:高光胁迫下,香果树叶片的净光合速率、核酮糖1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶活性和叶绿素含量显著下降,超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶和抗坏血酸过氧化物酶活性以及花青素和脱落酸含量显著升高.高光胁迫下,香果树的差异表达基因有6776个,其中上调和下调差异表达基因分别有3063和3713个.GO功能富集分析结果显示:上调和下调差异表达基因富集到的GO功能条目分别有2022和1835个,显著富集的GO功能条目分别有196和129个,基因功能均包括生物过程、分子功能和细胞组分3类.KEGG代谢通路富集分析结果显示:这些差异表达基因显著富集到次生代谢物生物合成、代谢途径、光合作用等20个代谢通路中.其中,光合作用相关基因Lhca4、Lhcb1、Lhcb2、Lhcb5、psaA、psaE、psaG、psaH、psaK、psaL、psaO、psbC、psbK、psbO、psbP、psbQ、psbR、psbW、petA、petC、petG、petE、atpC1、atpI、RBCS、rbcL、RCA、HEMA1、PORA以及脱落酸合成及信号通路相关基因NCED1、NCED3、CYP707A、PP2C51的表达水平显著下调;而光合作用相关基因psbS、atpA、atpD,花青素合成相关基因,抗氧化酶相关基因以及脱落酸合成及信号通路相关基因BGLU11、BGLU46、BGLU23、BGLU24、BGLU34、PYR/PYL、SnRK2C的表达水平显著上调.qRT-PCR验证结果显示:供试8个差异表达基因的表达水平与RNA-seq检测结果一致.综上所述,香果树主要通过调控光合作用、抗氧化酶系统、脱落酸代谢及信号通路以及花青素代谢通路响应高光胁迫.
文献关键词：
香果树;高光胁迫;转录组;差异表达基因;功能分析
中图分类号：
作者姓名：
宋丽莉;吴琼;吉喜燕;罗瑞莉;刘文娜;赵华强;侯梅芳
作者机构：
上海应用技术大学生态技术与工程学院,上海201418
文献出处：
引用格式：
[1]宋丽莉;吴琼;吉喜燕;罗瑞莉;刘文娜;赵华强;侯梅芳-.高光胁迫下香果树叶片生理生化指标变化及相关基因差异表达和功能分析)[J].植物资源与环境学报,2022(06):52-62,83
A类：
Lhca4,Lhcb1,Lhcb2,Lhcb5,psaE,psaG,psaH,psaK,psaL,psaO,psbO,psbP,psbQ,psbR,psbW,petA,petC,petG,petE,atpC1,atpI,HEMA1,PORA,CYP707A,PP2C51,psbS,BGLU11,BGLU46,BGLU23,BGLU24,BGLU34,SnRK2C
B类：
高光胁迫,香果树,果树叶片,叶片生理,生理生化指标,指标变化,基因差异表达,表达和功能,功能分析,光照强度,Emmenopterys,henryi,Oliv,幼苗,分生,seq,技术筛选,差异表达基因,表达分析,qRT,净光合速率,二磷酸,羧化酶,加氧酶,叶绿素含量,过氧化氢酶,抗坏血酸,过氧化物酶活性,脱落酸,酸含量,调差,功能富集分析,基因富集,条目,基因功能,生物过程,代谢通路,通路富集分析,到次,次生代谢物,生物合成,代谢途径,光合作用相关基因,psaA,psbC,psbK,RBCS,rbcL,RCA,NCED1,NCED3,而光,atpA,atpD,花青素合成,抗氧化酶相关基因,PYR,PYL,综上所述,抗氧化酶系统,酸代谢,花青素代谢,转录组
AB值：
0.242268
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