典型文献
国槐不同器官转录组分析及EST-SSR引物开发应用
文献摘要：
以国槐品种"青云1号"的根、茎、叶3种不同器官为材料,利用高通量测序技术分别对其进行转录组测序,筛选其根、茎、叶差异表达基因,进行生物信息学分析及EST-SSR分析.通过转录组两两对比筛选得到的根vs.茎、根vs.叶及茎vs.叶差异基因数分别为51937、52711和7193条,进一步对其进行GO及KEGG富集分析.结果表明:差异基因显著富集于代谢过程、催化活性、糖酵解和糖质新生等功能.EST-SSR分析表明,国槐根、茎、叶的SSR序列长度均在10～80bp间变化,主要以10～22 bp的短序列为主,且主要以单核苷酸重复为主,从30对有效性引物中筛选出9对多态性较高的引物,并构建了 11个不同国槐无性系的指纹图谱.
文献关键词：
国槐;转录组;基因;EST-SSR;遗传多样性
中图分类号：
作者姓名：
郁洁;徐立人;庞新博;刘朝华;李泳潭;原阳晨;董研
作者机构：
河北农业大学林学院,河北保定071000;河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定071000;河北农业大学园林与旅游学院,河北保定071000;河北省洪崖山国有林场,河北保定074200
文献出处：
引用格式：
[1]郁洁;徐立人;庞新博;刘朝华;李泳潭;原阳晨;董研-.国槐不同器官转录组分析及EST-SSR引物开发应用)[J].西南林业大学学报,2022(07):48-58
A类：
80bp
B类：
国槐,不同器官,转录组分析,EST,SSR,引物开发,开发应用,青云,高通量测序技术,转录组测序,差异表达基因,生物信息学分析,两对,选得,差异基因,富集分析,代谢过程,催化活性,糖酵解,单核苷酸,多态性,同国,无性系,指纹图谱,遗传多样性
AB值：
0.303109
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