典型文献
基于高通量测序技术的北豆根转录组数据分析
文献摘要：
目的:分析北豆根转录组信息特征.方法:采用二代高通量测序技术对北豆根进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析.结果:转录组测序共得到37346个Unigene,平均长度986 nt,其中有20562个Unigene得到注释.采用微卫星识别工具(MISA)方法共鉴定出81种重复单元共9948个简单重复序列(SSRs).挖掘到21个Unigene参与北豆根活性成分的生物合成,涉及(S)-乌药碱N-甲基转移酶、多酚氧化酶、酪氨酸转氨酶、伯胺氧化酶、天冬氨酸转氨酶(细胞质)、天冬氨酸转氨酶(线粒体)、天冬氨酸转氨酶(叶绿体)和酪氨酸脱羧酶等8种酶基因.结论:揭示了参与北豆根活性成分生物合成的关键基因,为进一步研究活性成分代谢途径和调控机制奠定基础.
文献关键词：
北豆根;蝙蝠葛;转录组;蝙蝠葛碱
中图分类号：
作者姓名：
杨宝
作者机构：
山西省检验检测中心山西省标准计量技术研究院,山西太原030012
文献出处：
引用格式：
[1]杨宝-.基于高通量测序技术的北豆根转录组数据分析)[J].山西中医药大学学报,2022(04):317-323
A类：
B类：
高通量测序技术,北豆根,转录组数据,信息特征,二代高通量测序,转录组测序,生物信息学分析,Unigene,平均长度,nt,微卫星,识别工具,MISA,法共,简单重复序列,SSRs,活性成分,生物合成,乌药碱,甲基转移酶,多酚氧化酶,伯胺,天冬氨酸转氨酶,细胞质,叶绿体,酪氨酸脱羧酶,酶基因,分生,关键基因,代谢途径,调控机制,蝙蝠葛碱
AB值：
0.339337
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