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典型文献
基于基因组不稳定性相关lncRNA的宫颈癌患者预后模型
文献摘要:
结合TCGA数据库中宫颈癌的lncRNA表达谱和体细胞突变谱,构建基于突变假设的计算框架,鉴定出36个与宫颈癌基因组不稳定性相关的lncRNA;对其共表达的基因功能进行分析,发现与36个lncRNA共表达的基因在2-氧代戊二酸代谢过程和2-氧羧酸代谢通路中富集.构建了基于基因组不稳定性衍生的两个lncRNA的基因特征(GILncSig),将Train组患者分为高风险组和低风险组,两组患者生存率显著不同,这一结果在Test组患者中得到进一步验证.通过独立预后分析,结果显示GILncSig可独立于其他临床性状,作为宫颈癌患者的整体生存相关独立预后因子.总之,本研究为进一步探讨lncRNA在基因组不稳定性中的作用提供了关键的方法和资源,为识别基因组不稳定性相关的肿瘤标志物提供了新的预测方法.
文献关键词:
宫颈癌;基因组不稳定性;长非编码RNA;突变表型
作者姓名:
康敏;余敏敏
作者机构:
南京市第二医院/南京中医药大学附属南京医院,南京210003
文献出处:
引用格式:
[1]康敏;余敏敏-.基于基因组不稳定性相关lncRNA的宫颈癌患者预后模型)[J].生物信息学,2022(04):264-273
A类:
GILncSig
B类:
基因组不稳定性,lncRNA,宫颈癌患者,预后模型,TCGA,中宫,表达谱,体细胞突变,突变谱,计算框架,癌基因,共表达,基因功能,酸代谢,代谢过程,羧酸,代谢通路,中富,基因特征,Train,高风险组,低风险组,Test,预后分析,预后因子,总之,肿瘤标志物,长非编码,突变表型
AB值:
0.29798
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