典型文献
肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系
文献摘要:
CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统,参与特异性防御不同类型的可移动遗传元件,如质粒、噬菌体、转座子等的入侵.旨在分析肠球菌(Enterococcus)基因组中该系统的基因结构,并探讨其与细菌耐药基因之间的关系.NCBI数据库中下载10种肠球菌的全基因组信息,利用软件对CRISPR-Cas系统的分布、cas1基因、重复序列、间隔序列等进行比对分析;查找耐药相关基因,分析其与CRISPR-Cas系统之间的关系.235株肠球菌中含完整CRISPR-cas系统的有35株(14.9%),含确定CRISPR阵列196个和cas基因簇46个.肠球菌基因组中CRISPR系统主要为II-A型(80.4%),其次是II-C型(15.2%),cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致.肠球菌CRISPR-Cas系统的分布在不同菌种之间差异较大;CRISPR-Cas系统可能阻碍肠球菌某些耐药基因的水平转移.
文献关键词:
肠球菌属;基因结构;CRISPR-Cas系统;耐药基因;免疫防御
中图分类号:
作者姓名:
兰蕾;郑旭;迟媛媛;王雪婷;王梦园;朱元祺;闫志勇
作者机构:
青岛大学 医学部,山东 青岛 266071;青岛大学 附属青岛市立医院,山东 青岛 266001;青岛大学 附属青岛妇女儿童医院,山东 青岛 266034;青岛大学 附属医院,山东 青岛 266071
文献出处:
引用格式:
[1]兰蕾;郑旭;迟媛媛;王雪婷;王梦园;朱元祺;闫志勇-.肠球菌CRISPR-Cas系统基因结构的分析及其与耐药基因的关系)[J].微生物学杂志,2022(02):58-64
A类:
cas1
B类:
CRISPR,Cas,基因结构,耐药基因,适应性免疫,免疫系统,可移动遗传元件,质粒,噬菌体,转座子,Enterococcus,细菌耐药,NCBI,下载,全基因组,基因组信息,利用软件,重复序列,间隔序列,比对分析,基因簇,II,基因序列,系统发育分析,菌种,水平转移,肠球菌属,免疫防御
AB值:
0.297161
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