典型文献
产气荚膜梭菌前噬菌体的分布特点及遗传进化分析
文献摘要：
[目的]分析和研究产气荚膜梭菌中前噬菌体的分布情况、基因组特点及遗传进化关系.[方法]利用PHASTER(phage search tool enhanced release)软件预测产气荚膜梭菌携带的前噬菌体,基于 ANI(average nucleotide identity)值对前噬菌体进行分群,利用 CARD(comprehensive antibiotic research database)、ResFinder 4.1、VFDB(virulence factors database)和 BacMet(antibacterial biocide&metal resistance genes database)分析前噬菌体携带的耐药基因、毒力基因、抗菌剂/金属离子抗性基因,利用CRISPRCasFinder分析产气荚膜梭菌的CRISPR-Cas系统,利用MEGA7.0进行前噬菌体的遗传进化关系分析.[结果]产气荚膜梭菌平均携带前噬菌体2.67条,其长度呈双峰分布,平均占基因组2.23％;前噬菌体不携带耐药基因,但携带了 α毒素、唾液酶和溶血素等毒力基因以及重金属代谢基因;前噬菌体聚为3个类群,Group 1前噬菌体多为完整的前噬菌体且仅存在于A型产气荚膜梭菌;含完整的CRISPR-Cas系统的产气荚膜梭菌携带的前噬菌体相对较少,但CRISPR-Cas系统与前噬菌体的数量呈弱负相关;前噬菌体与产气荚膜梭菌噬菌体的遗传进化距离较远,仅有结构蛋白和部分酶类基因的同源性较高.[结论]产气荚膜梭菌普遍携带前噬菌体,但其CRISPR-Cas系统对前噬菌体的数量影响较小,前噬菌体携带的毒力基因和重金属代谢基因增强了产气荚膜梭菌致病性和对环境的适应性,但其功能和对产气荚膜梭菌遗传进化的影响仍需深入研究.
文献关键词：
产气荚膜梭菌;前噬菌体;分布特点;CRISPR-Cas系统;遗传进化
中图分类号：
作者姓名：
韩生义;卢晓凤;李淑萍;林伟山;胡国元;石田;李生庆
作者机构：
青海大学畜牧兽医科学院,青海西宁810003;青海大学农牧学院,青海西宁810003
文献出处：
引用格式：
[1]韩生义;卢晓凤;李淑萍;林伟山;胡国元;石田;李生庆-.产气荚膜梭菌前噬菌体的分布特点及遗传进化分析)[J].微生物学报,2022(07):2610-2623
A类：
BacMet,CRISPRCasFinder
B类：
产气荚膜梭菌,前噬菌体,遗传进化分析,分析和研究,进化关系,PHASTER,phage,tool,enhanced,release,软件预测,测产,ANI,average,nucleotide,identity,分群,CARD,comprehensive,antibiotic,research,database,ResFinder,VFDB,virulence,factors,antibacterial,biocide,metal,resistance,genes,分析前,耐药基因,毒力基因,抗菌剂,金属离子,抗性基因,析产,MEGA7,关系分析,双峰分布,唾液,溶血素,代谢基因,类群,Group,仅存,弱负相关,进化距离,较远,结构蛋白,酶类,同源性,基因增强,致病性
AB值：
0.263543
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
