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典型文献
不同来源杀鲑气单胞菌毒力因子的比较基因组学研究
文献摘要:
自凡纳滨对虾养殖水体中分离得到1株杀鲑气单胞菌YK-48,为确定YK-48与在鞍山养殖场金鱼体内分离出来的AS.17和烟台大西洋鲑体内分离出来的S68和S121等不同来源的杀鲑气单胞菌的毒力基因特征之间是否存在差异,对YK-48的形态、生理生化特征和药物敏感性进行分析,随后进行全基因组测序,对4株杀鲑气单胞菌进行基因组基本特征分析、毒力基因注释和耐药基因分析.通过系统发育分析发现,YK-48与AS.17聚类在一起,说明其为相同亚型中的同一克隆群.药敏试验结果显示,YK-48对利福平、杆菌肽、万古霉素和青霉素耐药.对毒力基因进行分析,菌株AS.17和YK-48的毒力基因结果基本一致;与S68和S121相比,抗吞噬作用和免疫调节相关表达的基因为AS.17和YK-48特有的基因;通过细菌黏附试验,验证了菌株YK-48不含黏附相关基因.通过基因组学对3种来源杀鲑气单胞菌进行比较,可为解析不同来源杀鲑气单胞菌毒力基因特征提供参考,并为其防控积累数据.
文献关键词:
杀鲑气单胞菌;耐药基因;毒力基因;插入序列;系统发育
作者姓名:
郝婧薇;王艺;贺凤兰;傅松哲;申旭东;刘鹰
作者机构:
大连海洋大学 海洋科技与环境学院,辽宁 大连 116023;大连海洋大学,设施渔业教育部重点实验室,辽宁 大连 116023;河北科技师范学院 海洋资源与环境学院,河北 秦皇岛 066000;南昌市疾病预防控制中心,江西 南昌 330038;中国水产科学研究院 营口增殖实验站,辽宁 营口 115004
文献出处:
引用格式:
[1]郝婧薇;王艺;贺凤兰;傅松哲;申旭东;刘鹰-.不同来源杀鲑气单胞菌毒力因子的比较基因组学研究)[J].水产科学,2022(02):192-201
A类:
S68,S121
B类:
不同来源,杀鲑气单胞菌,毒力因子,比较基因组学,组学研究,凡纳滨对虾,对虾养殖,养殖水体,YK,鞍山,养殖场,金鱼,鱼体,分离出来,AS,烟台,台大,大西洋鲑,毒力基因,基因特征,生理生化特征,药物敏感性,全基因组测序,基因注释,耐药基因,基因分析,系统发育分析,一克,药敏试验,利福平,杆菌肽,万古霉素,青霉素,吞噬作用,免疫调节,过细,细菌黏附,插入序列
AB值:
0.267184
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