典型文献
一株新型旱獭源性宽谱大肠杆菌噬菌体的分离鉴定及基因组分析
文献摘要：
[目的]分离喜马拉雅旱獭肠内容物样本中的噬菌体,并研究其生物学特性和基因组特征.[方法]以大肠杆菌为宿主菌,利用双层琼脂平板法从喜马拉雅旱獭肠内容物样本中分离噬菌体;用透射电镜观察形态特征;测定其最佳感染复数、一步生长曲线、酸碱耐受度及宿主裂解谱等生物学特性,并进行全基因组测序.[结果]从喜马拉雅旱獭肠内容物样本中分离得到一株裂解性大肠杆菌噬菌体,命名为vB EcoM_TH18,其噬菌斑呈无晕环的透亮圆形,透射电镜观察发现该噬菌体头部直径为(90±5)nm,尾部长度为(115±5)nm;最佳感染复数为1;一步生长曲线显示其潜伏期为10 min,110 min后进入平台期,平均裂解量为15 PFU/mL;在pH4.5-9.5的范围内具有稳定活性;可裂解多种致病型和血清型大肠杆菌和宋内志贺氏菌,无法裂解沙门氏菌、屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌及鲍曼不动杆菌;基因组测序结果表明,其基因组长度为133 882 bp,GC含量为39.95％.基因组共注释到210个编码序列(CDS)和13个tRNAs,不含毒力基因及耐药基因.BLASTn比对结果表明该基因组与Avunavirus属噬菌体Av-05同源性为95.17％.基于噬菌体全基因组、主要衣壳蛋白和终止酶大亚基分别构建系统进化树,结果表明vB_EcoM_TH18是一株肌尾噬菌体科(Myoviridae)Avunavirus属的新型噬菌体.[结论]从喜马拉雅旱獭肠内容物中成功分离并鉴定了一株新型宽谱大肠杆菌噬菌体vB_EcoM_TH18,可裂解多种致病型和血清型的大肠杆菌及宋内志贺菌.
文献关键词：
噬菌体;大肠杆菌;肌尾噬菌体科;生物学特性
中图分类号：
作者姓名：
黄倩妮;陶媛美慧;黄虞远;濮吉;罗雪莲;金东;杨晶;徐建国
作者机构：
广西医科大学公共卫生学院,广西南宁530021;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206;中国医学科学院,未知微生物发现和功能研究院外创新单元,北京100005;南开大学公共卫生和健康研究院,天津300071
文献出处：
引用格式：
[1]黄倩妮;陶媛美慧;黄虞远;濮吉;罗雪莲;金东;杨晶;徐建国-.一株新型旱獭源性宽谱大肠杆菌噬菌体的分离鉴定及基因组分析)[J].微生物学报,2022(09):3503-3517
A类：
TH18,BLASTn,Avunavirus
B类：
一株,大肠杆菌,分离鉴定,基因组分析,喜马拉雅旱獭,肠内,内容物,生物学特性,基因组特征,宿主菌,琼脂,透射电镜,电镜观察,最佳感染复数,一步生长曲线,酸碱,耐受度,裂解谱,全基因组测序,vB,EcoM,菌斑,晕环,透亮,观察发现,尾部,部长,潜伏期,平台期,均裂,裂解量,PFU,pH4,致病型,血清型,志贺氏菌,沙门氏菌,屎肠球菌,金黄色葡萄球菌,肺炎克雷伯杆菌,鲍曼不动杆菌,组长,bp,编码序列,CDS,tRNAs,毒力基因,耐药基因,同源性,体全,衣壳蛋白,亚基,建系,系统进化树,肌尾噬菌体科,Myoviridae,功分,宋内志贺菌
AB值：
0.281729
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