典型文献
生物信息学分析TP53基因在肝癌中的表达及其对预后的影响
文献摘要:
目的:利用在线数据库探讨TP53在肝细胞癌(肝癌)中的表达及其对预后的影响。方法:利用Sangerbox Tools平台分析TP53基因在常见肿瘤中的表达;UALCAN数据库分析TP53基因与肝癌患者临床特征的关系;Kaplan-Meier Plotter数据库分析TP53表达与肝癌患者预后的关系;CBioPortal数据库分析TP53基因突变和表达改变对肝癌患者生存预后的影响。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果:Sangerbox Tools平台分析显示,肝癌中TP53基因表达明显高于正常肝组织(P<0.001)。UALCAN数据库和CBioPortal数据库分析显示,在美国癌症联合委员会(AJCC)分期Ⅰ、Ⅲ期,肝癌组织学分级1、3级和2、3级中,TP53表达差异有统计学意义(P=0.024,<0.001,0.012);TP53表达与性别有关,女性患者中TP53表达明显升高(P=0.013)。CBioPortal数据库分析发现,TP53基因突变率与肝癌组织学分级有关,随着组织学分级增加突变率升高(P<0.001)。UALCAN数据库分析显示,低表达TP53的患者总体生存更好(P=0.019)。CBioPortal数据库分析显示,TP53基因无突变患者的总体生存、疾病特异性生存、无进展生存、无病生存明显优于TP53基因突变的患者(HR=8.002,6.592,5.591,5.618;P<0.05)。结论:在线数据库分析发现,TP53在肝癌中高表达,TP53表达水平与肝癌患者临床特征和预后相关,低表达患者预后好,TP53基因无突变患者预后好。
文献关键词:
基因,p53;癌,肝细胞;预后;计算生物学
中图分类号:
作者姓名:
杨洲;叶林森;冯啸;谢云亮;李晓斌;傅斌生
作者机构:
510630 广州,中山大学附属第三医院肝脏外科
文献出处:
引用格式:
[1]杨洲;叶林森;冯啸;谢云亮;李晓斌;傅斌生-.生物信息学分析TP53基因在肝癌中的表达及其对预后的影响)[J].中华肝脏外科手术学电子杂志,2022(01):87-91
A类:
CBioPortal
B类:
生物信息学分析,TP53,肝细胞癌,Sangerbox,Tools,UALCAN,数据库分析,肝癌患者,Kaplan,Meier,Plotter,基因突变,生存预后,生存分析,Log,rank,肝组织,美国癌症联合委员会,AJCC,肝癌组织,组织学分级,表达差异,女性患者,突变率,低表达,总体生存,无进展生存,无病生存,p53,计算生物学
AB值:
0.231809
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