典型文献
基于生物信息学方法分析E3泛素连接酶DTL在肝细胞癌中的表达与预后意义
文献摘要：
目的:探讨E3泛素连接酶DTL(dentideless E3 ubiquitin ligase)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及预后价值.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载获得374例HCC组织和50例癌旁正常组织的转录组数据;从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载GSE121248数据集,获得包括70例HCC组织和37例癌旁正常组织的转录组数据.比较HCC组织与癌旁正常组织中DTL的表达水平.采用Kaplan-Meier法进行生存分析,并采用log-rank检验比较DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者总生存率、无进展间期生存率的差异.HCC患者不良预后的危险因素采用Cox回归分析.绘制DTL表达水平诊断HCC的受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线.利用基于多因素Cox回归分析的列线图预测DTL对HCC患者预后的影响.同时对DTL高表达组与DTL低表达组HCC组织的差异表达基因进行GSEA富集分析.结果:DTL在HCC组织中的表达水平高于癌旁正常组织(P<0.001).DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者年龄、人种、AFP水平、病理分级、病理分期、T分期差异均有统计学意义(P均<0.05).Kaplan-Meier法生存分析结果显示,与DTL低表达组HCC患者相比,DTL高表达组HCC患者总生存率和无进展间期生存率均较短(P=0.005,P<0.001).ROC曲线显示,DTL表达水平对HCC有较强的诊断能力[曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.96].通过构建列线图发现,DTL表达的C指数为0.663(95％CI为0.54～0.61).GSEA富集分析结果显示,DTL可能通过影响细胞周期、染色体维持、DNA复制、G2/M检查点、有丝分裂期、TP53转录调控等通路影响HCC的发生发展.
文献关键词：
DTL;肝细胞癌;预后
中图分类号：
作者姓名：
刘振荣;肖汀
作者机构：
国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室/癌发生及预防分子机理北京市重点实验室,北京 100021
文献出处：
引用格式：
[1]刘振荣;肖汀-.基于生物信息学方法分析E3泛素连接酶DTL在肝细胞癌中的表达与预后意义)[J].肝癌电子杂志,2022(01):41-47
A类：
dentideless,GSE121248
B类：
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AB值：
0.309999
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