典型文献
染色体结构维持蛋白4在胰腺癌中表达的临床与生物信息学分析
文献摘要：
目的 研究染色体结构维持蛋白4(structural maintenance of chromosome 4,SMC4)在胰腺癌组织中的表达差异及其与临床病理特征和预后的关系,并探讨其可能发生相互作用的蛋白网络及调控的可能信号通路.方法 采用Western blotting检测中国人民解放军中部战区总医院收集的12例胰腺癌组织及癌旁组织中SMC4蛋白表达,比较表达的差异.比较GEPIA数据库中SMC4在胰腺癌组织及正常胰腺组织中的mRNA表达差异.采用Cox回归、Kaplan-Meier法分析TCGA数据库中SMC4基因表达差异与胰腺癌患者临床病理特征和预后的关系.通过STRING数据库分析与SMC4相互作用的蛋白网络.采用GSEA预测TCGA数据库中SMC4在胰腺癌中调控的可能信号通路.结果 SMC4的临床表达:(1)对我院的12例样本Western blotting检测显示SMC4在胰腺癌组织中的蛋白表达量高于癌旁组织;(2)GEPIA数据库分析显示SMC4在胰腺癌组织中的mRNA表达量高于正常胰腺组织;(3)TCGA数据库分析结果显示SMC4基因表达水平与胰腺癌患者的病理分级和T分期密切相关.Cox分析结果显示,SMC4 mRNA表达水平和N分期是胰腺癌患者预后的独立危险因素.SMC4高表达组胰腺癌患者的生存时间显著低于SMC4低表达组患者.生物信息学分析结果:(1)STRING数据库分析表明与SMC4相互作用蛋白有NCAPH、NCAPG、SMC2等;(2)GSEA研究显示,SMC4 mRNA高表达样本富集到ERBB信号通路、WNT信号通路、TGF-β信号通路等相关基因集.结论 SMC4在胰腺癌中高表达,且与胰腺癌不良预后密切相关,可能通过调节SMC2等相互作用蛋白及激活TGF-β等信号通路在胰腺癌发生发展中发挥促癌作用.
文献关键词：
染色体结构维持蛋白4(SMC4);胰腺癌;生物信息学分析;临床样本分析;表达差异;蛋白网络
中图分类号：
作者姓名：
孙炜玮;马丹丹;董庆泰;李中虎;林振宇;金炜东;杨瑞
作者机构：
中国人民解放军中部战区总医院 普通外科,湖北 武汉 430070
文献出处：
引用格式：
[1]孙炜玮;马丹丹;董庆泰;李中虎;林振宇;金炜东;杨瑞-.染色体结构维持蛋白4在胰腺癌中表达的临床与生物信息学分析)[J].肝胆胰外科杂志,2022(04):227-232
A类：
B类：
生物信息学分析,structural,maintenance,chromosome,SMC4,胰腺癌组织,临床病理特征,蛋白网络,blotting,中国人民解放军,军中,战区,总医院,癌旁组织,GEPIA,胰腺组织,Cox,Kaplan,Meier,TCGA,基因表达差异,STRING,数据库分析,GSEA,我院,基因表达水平,病理分级,生存时间,低表达,相互作用蛋白,NCAPH,NCAPG,SMC2,ERBB,WNT,TGF,不良预后,白及,促癌作用,临床样本分析
AB值：
0.211553
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