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典型文献
膜联蛋白A5在胰腺癌中的预后意义及机制的生物信息学分析
文献摘要:
背景与目的:胰腺癌是一种诊断较晚、预后差的侵袭性疾病,对于胰腺癌的分子机制研究对改善胰腺癌患者的预后具有重要意义.膜联蛋白A5(ANXA5)与人类肿瘤的发生与发展关系密切,但ANXA5与胰腺癌患者预后的关系及具体机制尚不十分清楚.本研究通过生物信息学分析结合实验验证探讨ANXA5的表达与胰腺癌预后的关系及其作用机制.方法:从TCGA和GEO数据库(GSE15471、GSE16515、GSE21501)下载胰腺癌转录组及临床数据,利用R包分析GEO数据库中ANXA5基因在胰腺癌组织与癌旁正常组织的表达情况,并利用GEPIA在线网站分析TCGA数据库中胰腺癌患者组织与GTEx数据库中正常组织ANXA5基因表达情况.采用Kaplan-Meier 的方法分析 ANXA5 的表达水平对胰腺癌患者总生存时间的影响,然后单因素及多因素Cox分析判断胰腺癌相关危险因素,并利用GSEA分析ANXA5在胰腺癌中可能的信号通路并分析其相关性.最后采用免疫组织化学法检测49例胰腺癌组织和癌旁组织中ANXA5的表达,并分析其与预后及胰腺癌临床病理特征的关系.结果:数据库分析显示,在GSE15471与GSE16515数据集,以及TCGA数据库中ANXA5在胰腺癌组织中的均表达明显升高(均P<0.05);在GSE21501数据集与TCGA数据库中ANXA5高表达的患者总体生存期明显短于低表达患者(均P<0.05);TCGA中ANXA5表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.819,95%CI=1.058~3.126,P=0.03);ANXA5基因与胰腺癌TGF-β通路及肿瘤上皮-间质转化(EMT)高度相关.胰腺癌组织样本分析结果显示,ANXA5的表达明显高于癌旁组织(P<0.001),且此基因高表达预示着较差的预后(P=0.008 2);ANXA5表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=3.06,95%CI=1.046~8.952,P=0.041);ANXA5的表达与肿瘤临床分期(P=0.000 94)及淋巴结转移(P<0.001)明显相关.结论:ANXA5在胰腺癌中表达升高,其高表达是胰腺癌患者预后的危险因素,其机制可能是通过TGF-β通路及EMT进程促进胰腺癌发展有关.
文献关键词:
胰腺肿瘤;膜联蛋白A5;预后;计算生物学
作者姓名:
仲成成;李铭旭;张功铭;胡伟;王仲
作者机构:
徐州医科大学附属连云港医院肝胆外科,江苏连云港222001;徐州医科大学附属连云港医院病理科,江苏连云港222001
引用格式:
[1]仲成成;李铭旭;张功铭;胡伟;王仲-.膜联蛋白A5在胰腺癌中的预后意义及机制的生物信息学分析)[J].中国普通外科杂志,2022(09):1194-1202
A类:
GSE15471,GSE21501
B类:
膜联蛋白,预后意义,生物信息学分析,侵袭性疾病,ANXA5,肿瘤的发生与发展,发展关系,具体机制,分清,TCGA,GEO,GSE16515,下载,转录组,临床数据,包分析,胰腺癌组织,正常组织,GEPIA,线网,患者组织,GTEx,中正,Kaplan,Meier,总生存时间,Cox,分析判断,相关危险因素,GSEA,免疫组织化学法,癌旁组织,临床病理特征,数据库分析,总体生存期,低表达,TGF,间质转化,EMT,样本分析,预示,临床分期,淋巴结转移,胰腺肿瘤,计算生物学
AB值:
0.205817
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