背景与目的:丙酮酸脱氢酶El组分α亚基(PDHA1)是丙酮酸脱氢酶复合物的关键调控位点,发挥着连接糖酵解和三羧酸循环的重要作用,对癌症代谢转变具有重要意义.最新研究发现了一种新的细胞死亡方式,即铜死亡.PDHA1是铜死亡的相关基因,参与铜死亡过程的调控.本研究旨在利用生物信息学方法探讨PDHA1与乳腺癌预后的关系并建立预后相关的列线图模型.方法:运用 TCGA、TIMER、UALCAN、HPA、STRING、Gene MANIA、Kaplan-Meier、GEPIA、GeneCards等多个数据库对PDHA1在乳腺癌中的临床病理特征关系、表达情况、蛋白互相作用网络、基因-基因互作网络、预后价值、基因集富集分析等进行分析,并使用R语言构建列线图模型.结果:PDHA1表达水平与乳腺癌T分期(P＜0.001)、病理分期(P=0.031)、人种(P＜0.001)、组织学类型(P＜0.001)、PR状态(P＜0.001)、ER状态(P＜0.001)、PAM50亚型(P＜0.001)有关.TCGA数据库结果显示,乳腺癌组织PDHA1 mRNA的表达水平明显低于正常乳腺组织(P＜0.001),UALCAN数据库结果显示,PDHA1蛋白在乳腺癌中低表达(P＜0.001),HPA数据库进一步验证了该结果.PPI蛋白互作网络显示有15个与PDHA1相关的互作蛋白.基因-基因互作关系网络图得到20个PDHA1相关的互作基因.PDHA1高表达组患者的总生存期(HR=1.26,95％CI=1.02～1.54,P=0.029)、无复发生存期(HR=1.18,95％CI=1.05～1.32,P=0.005 1)、进展后生存期(HR=1.41,95％CI=1.07～1.86,P=0.015)、无转移生存期(HR=1.29,95％CI=1.1～1.52,P=0.002 3)均低于PDHA1低表达组.GSEA结果表明PDHA1共表达基因在乳腺癌中主要参与S期、三羧酸循环等通路.从GeneCards中找到10种与PDHA1表达相关的化合物.将PDHA1表达、年龄、放疗、N分期和M分期纳入构建列线图,校准图显示列线图预测和实际观察之间有极好的一致性.结论:PDHA1高表达乳腺癌患者预后较PDHA1低表达患者差.PDHA1表达水平是影响乳腺癌患者预后的相关因素.基于PDHA1表达的列线图模型对于乳腺癌患者预后的评估有一定的价值.

乳腺肿瘤;丙酮酸脱氢酶E1组分α亚基;预后;计算生物学;列线图

杨秋怡;易嘉宁;郭妙兰;范培芝;喻洁;曾杰

湖南师范大学附属第一医院/湖南省人民医院乳甲外科,湖南长沙410005

中国普通外科杂志

[1]杨秋怡;易嘉宁;郭妙兰;范培芝;喻洁;曾杰-.铜死亡相关基因PDHA1与乳腺癌的预后关系及列线图的构建)[J].中国普通外科杂志,2022(11):1471-1482

PAM50

铜死亡相关基因,PDHA1,预后关系,丙酮酸脱氢酶,El,亚基,复合物,糖酵解,三羧酸循环,癌症代谢,细胞死亡方式,利用生物,生物信息学方法,列线图模型,TCGA,TIMER,UALCAN,HPA,STRING,MANIA,Kaplan,Meier,GEPIA,GeneCards,临床病理特征,特征关系,基因互作,预后价值,基因集富集分析,语言构建,病理分期,人种,组织学类型,PR,癌组织,低于正常,常乳,乳腺组织,低表达,PPI,蛋白互作网络,互作蛋白,互作关系,关系网络,网络图,互作基因,总生存期,无复发生存期,GSEA,共表达基因,放疗,极好,乳腺癌患者,乳腺肿瘤,E1,计算生物学

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