典型文献
线粒体相关凋亡因子2在肝细胞癌中的表达及其基因调控网络
文献摘要：
背景与目的:铁死亡可作为抗肿瘤作用的新靶点,线粒体相关凋亡因子2 (AIFM2)是铁死亡的一个关键调控因子.本研究分析AIFM2在肝细胞癌(HCC)中的表达水平及其与患者临床病理因素、预后的关系,并探讨AIFM2在HCC中的调控网络.方法:利用Oncomine数据库分析AIFM2在HCC和正常肝组织中的表达差异,利用UALCAN数据库分析AIFM2表达与患者临床病理特征的相关性;用LinkedOmics数据平台的LinkFinder模块进行GO分析和KEGG分析;用LinkedOmics数据库分析与AIFM2表达相关的蛋白激酶、miRNA和转录因子;用Gene-MANIA数据库分析与AIFM2相关的蛋白质相互作用网络;用cBioPortal分析HCC中AIFM2突变的频率和类型.结果:HCC组织中AIFM2 mRNA表达和DNA拷贝数均高于正常组织(均P＜0.05).AIMF2与晚期肿瘤、淋巴结转移、较高的病理分级和TP53突变明显有关(均P＜0.05).高表达AIFM2的患者明显比低表达AIFM2患者的预后差(P=0.034).GO和KEGG分析显示,AIFM2相关基因主要富集与线粒体和核糖体功能有关的途径,与细胞氧化磷酸化和转录后翻译密切相关.GSEA分析表明,多种蛋白激酶(MAPK1/3/7)、miRNA(miR-30家族)和转录因子(NFAT)与AIFM2的表达密切相关.cBioPortal分析显示,AIFM2在HCC中的主要变异形式是高mRNA表达,但突变频率低.结论:AIFM2在HCC中高表达,与患者不良预后相关,是HCC诊断和预后的潜在标志物.所揭示的AIFM2在HCC中的调控网络为AIFM2在HCC中的后续研究奠定基础.
文献关键词：
癌,肝细胞;线粒体相关凋亡因子2;预后;大数据;计算生物学
中图分类号：
作者姓名：
罗可;刘添皇
作者机构：
广东省梅州市人民医院肝病科,广东梅州514031
文献出处：
引用格式：
[1]罗可;刘添皇-.线粒体相关凋亡因子2在肝细胞癌中的表达及其基因调控网络)[J].中国普通外科杂志,2022(01):97-106
A类：
AIFM2,LinkFinder,AIMF2
B类：
凋亡因子,肝细胞癌,基因调控网络,铁死亡,抗肿瘤作用,新靶点,调控因子,HCC,临床病理因素,Oncomine,数据库分析,肝组织,表达差异,UALCAN,临床病理特征,LinkedOmics,蛋白激酶,miRNA,Gene,MANIA,蛋白质相互作用网络,cBioPortal,拷贝数,正常组织,晚期肿瘤,淋巴结转移,病理分级,TP53,低表达,核糖体,氧化磷酸化,GSEA,种蛋,MAPK1,NFAT,异形,突变频率,不良预后,诊断和预后,潜在标志物,计算生物学
AB值：
0.252042
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