典型文献
糖尿病肾病相关基因的生物信息学分析
文献摘要：
目的:从基因层面对糖尿病肾病发病机制进行探讨,为糖尿病肾病的诊断及治疗提供新的思路.方法:从NCBI网站的GEO数据库中下载芯片数据,利用BRB-ArrayTools筛选出差异表达基因,运用GATHER及STRING软件对差异表达基因进行GO本体分析,KEGG通路分析及蛋白相互作用网络分析,Cytoscape软件计算节点中心度得出关键节点基因.结果:BRB-ArrayTools筛选出57个差异表达基因,其中上调17个,下调40个,GO本体分析显示差异表达基因主要与应激反应、免疫反应、压力应对、器官形态发生、细胞基质黏连、细胞增殖调节等生物过程有关,KEGG信号通路分析显示差异表达基因参与糖类、脂肪酸、卟啉、激素代谢以及细胞骨架的调控以及Hedgehog信号通路、免疫补体途径、钙信号通路、TGF-β信号通路、磷脂酰肌醇信号转导,Cytoscape 软件计算得出 VEGFA、THBS1、ITGB1、THSD7A、TUBB4A、MME、CYP2C8、FOXC1为关键节点基因.结论:利用生物信息学分析方法能够深入挖掘芯片信息,为糖尿病肾病的诊断及治疗提供了新的靶点,但仍需进一步实验验证.
文献关键词：
糖尿病肾病;基因;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张颜;张育安
作者机构：
云南省第三人民医院肾病科 昆明 650011
文献出处：
引用格式：
[1]张颜;张育安-.糖尿病肾病相关基因的生物信息学分析)[J].中国中西医结合肾病杂志,2022(03):254-258
A类：
ArrayTools,GATHER,TUBB4A
B类：
生物信息学分析,对糖尿病肾病,诊断及治疗,NCBI,GEO,下载,BRB,出差,差异表达基因,STRING,通路分析,蛋白相互作用网络分析,Cytoscape,软件计算,计算节点,节点中心度,关键节点,节点基因,应激反应,免疫反应,压力应对,形态发生,黏连,生物过程,糖类,卟啉,激素代谢,细胞骨架,Hedgehog,补体,钙信号通路,TGF,磷脂酰肌醇,信号转导,VEGFA,THBS1,ITGB1,THSD7A,MME,CYP2C8,FOXC1,利用生物
AB值：
0.339804
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