典型文献
糖尿病肾病患者两种不同组织差异基因的相关分析
文献摘要：
目的 利用生物信息技术筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)与肾小球组织的差异基因,筛选诊断DN的生物标志物和治疗的靶向基因.方法 从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库GSE142153中提取DN患者和健康人PBMCs基因表达数据,从GSE30528芯片中提取DN患者和健康人肾小球基因表达数据,采用GEO在线分析软件GEO2R和Excel筛选差异表达基因.结果 DN患者的PBMCs中有201个差异表达基因,肾小球组织中有845个差异表达基因.PBMCs的差异基因主要参与DN肾脏炎症反应.肾小球组织的差异基因主要参与肾系统发育.两个组织中有以下基因同时差异表达,分别是 EMP1、MAFB、GADD45A、A TF3、RASL11B、F3、CCR2、TLR 7、EGF、TIPARP、P2RY14、CD24、IGKC、DACH1.其中 TLR7、CCR2、CD24、EGF、ATF3、MAFB、GADD45A、F3基因存在相互作用.结论 DN患者PBMCs和肾小球的差异基因不同,差异基因在DN中的作用机制也明显不同.有16个基因在DN的两个组织中同时差异表达,可以作为诊断DN的生物标志物.利用共有差异基因在PBMCs和肾小球中的表达规律,也许可以对DN进行无创检测.有8个共有差异基因在PBMCs和肾小球中互相作用,可以作为DN治疗靶点.
文献关键词：
糖尿病肾病;生物信息分析;外周血单个核细胞;肾小球
中图分类号：
作者姓名：
张金铭;张莲;倪利华;冯惠玲;吴小燕
作者机构：
青武汉大学中南医院,武汉430071
文献出处：
引用格式：
[1]张金铭;张莲;倪利华;冯惠玲;吴小燕-.糖尿病肾病患者两种不同组织差异基因的相关分析)[J].临床肾脏病杂志,2022(08):630-637
A类：
GSE142153,GSE30528,RASL11B,TIPARP,P2RY14,IGKC
B类：
糖尿病肾病患者,不同组织,组织差异,利用生物,生物信息技术,技术筛选,diabetic,nephropathy,DN,外周血单个核细胞,peripheral,blood,mononuclear,cells,PBMCs,肾小球,生物标志物,gene,expression,omnibus,健康人,基因表达数据,在线分析,GEO2R,Excel,差异表达基因,肾脏炎症,系统发育,时差,EMP1,MAFB,GADD45A,CCR2,EGF,CD24,DACH1,TLR7,ATF3,共有差异基因,表达规律,也许,无创检测,治疗靶点,生物信息分析
AB值：
0.287339
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