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基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析
文献摘要：
目的 分析二代测序技术ghrelin作用后的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达.方法 从对照组(不添加ghrelin)和实验组(添加600 ng/mL ghrelin 24 h)的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中分别提取RNA进行测序,筛选出实验组发生差异表达的lncRNA,对其进行靶基因预测并将预测结果与差异mRNA取交集,对取交集后的基因进行GO分析和KEGG通路分析.结果 筛选获得差异表达的lncRNA有236个(上调130个,下调106个);差异表达mRNA有71个(上调66个,下调5个).差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA取交集筛选获得57个基因.GO和KEGG通路富集分析结果显示:这些差异表达lncRNA主要与精、赖氨酸跨膜转运,氧化应激反应及发育过程相关,并且主要富集在细胞因子受体信号通路、胰高血糖素和胰岛素信号通路及癌症相关信号通路上.结论 ghrelin作用后的人卵巢癌细胞中lncRNA的表达有差异,其可能参与卵巢癌的发生、发展,提示ghrelin可能在卵巢癌治疗中具有重要作用.
文献关键词：
卵巢癌;二代测序技术;ghrelin;长链非编码RNA
中图分类号：
作者姓名：
宋婉莹;萨日盖;高海宁;赵鹏伟
作者机构：
兴安盟人民医院,内蒙古 乌兰浩特 137400;内蒙古医科大学,内蒙古 呼和浩特010059;内蒙古医科大学基础医学院 微生物与免疫学研究室,内蒙古 呼和浩特 010059
文献出处：
引用格式：
[1]宋婉莹;萨日盖;高海宁;赵鹏伟-.基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析)[J].中国现代医学杂志,2022(09):25-31
A类：
B类：
二代测序技术,ghrelin,差异表达,lncRNA,生物信息学分析,人卵巢癌细胞株,SK,OV,长链非编码,靶基因预测,交集,通路分析,通路富集分析,赖氨酸,跨膜转运,氧化应激反应,细胞因子受体,胰高血糖素,胰岛素信号通路
AB值：
0.15119
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