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基于全转录组测序分析多形性胶质母细胞瘤增殖及侵袭的相关机制
文献摘要：
目的 通过对多形性胶质母细胞瘤(GBM)组织及癌旁组织的转录组测序及生物信息数据进行分析,挖掘导致GBM发生的关键基因并明确其功能,深入探讨GBM细胞增殖、侵袭及迁移的分子调控机制.方法 收集4例GBM患者的癌组织及癌旁组织进行全转录组测序分析,筛选差异表达的mRNA、微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA),并对其进行生物信息学分析[基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析和转录本富集分析等].构建mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA的关联网络,寻找与脑胶质瘤发生、迁移和侵袭密切相关的目标分子.结果 筛选出3088个癌组织与癌旁组织差异表达的mRNA,其中表达上调1375个、表达下调1713个;差异表达的lncRNA 106个,其中表达上调52个、表达下调54个;差异表达的circRNA 82个,其中表达上调32个、表达下调50个;差异表达的miRNA 15个,其中表达上调8个、表达下调7个.差异表达的mRNA转录本富集共得到显著性通路19条,涉及Shh(Sonic hedgehog)信号途径、胶质瘤信号途径、胰腺癌信号途径、轴突导向、肿瘤坏死因子(TNF)信号途径等通路.全转录组多元关联分析结果显示,BOC位于调控网络关键节点位置,与has-miR-4763-5p、has-miR-6848-5p、has-miR-6860 miRNA具有潜在的靶向结合位点.胶质瘤患者癌组织BOC mRNA水平明显高于癌旁组织(P<0.05).结论 BOC可能受相关miRNA、circRNA、lncRNA等非编码RNA的调控,影响下游靶基因的表达,进而影响GBM细胞的增殖、侵袭等生物学行为.
文献关键词：
全转录组测序;多形性胶质母细胞瘤;Hedgehog信号通路
中图分类号：
作者姓名：
王仕超;刘斌;赵星;任晓敏;潘园园;李霞;徐淑英
作者机构：
内蒙古自治区呼和浩特市第一医院医学遗传实验室,内蒙古呼和浩特 010030;内蒙古自治区人民医院神经内科,内蒙古呼和浩特 010030
文献出处：
引用格式：
[1]王仕超;刘斌;赵星;任晓敏;潘园园;李霞;徐淑英-.基于全转录组测序分析多形性胶质母细胞瘤增殖及侵袭的相关机制)[J].检验医学,2022(08):772-781
A类：
B类：
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AB值：
0.241083
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