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魔芋软腐病病原菌果胶杆菌ZX67菌株全基因组测序及分析
文献摘要：
菌株ZX67是魔芋软腐病病原菌胡萝卜果胶杆菌胡萝卜亚种(Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum),为进一步了解该病原菌的特性,便于更好地研究防治软腐病的方法,对该菌株进行了全基因组测序和分析.该菌株基因组总长度为4,909,724 bp,GC含量为51.27％,包含4,977个编码基因,其序列长度占总基因组的85.25％,预测的非编码RNA主要包括74个tRNA、22个rRNA及100个sRNA,有10个基因岛,6个转座子,预测存在2个前噬菌体,每个前噬菌体的平均长度为26,258 bp,有5个CRISPR序列,每个序列的平均长度为621 bp,并分析了与降解寄主细胞壁相关的裂解酶、与侵染植物相关的5种蛋白分泌系统.以上结果,为进一步了解软腐病病原菌的特性提供了机会,也为研究新的防治方法提供了新的出发点和思路.
文献关键词：
胡萝卜果胶杆菌;软腐病;魔芋;全基因组;测序
中图分类号：
作者姓名：
夏涛;李梦飞;张雯;陈雪英;史银连;王红莹;李刚;祝伟
作者机构：
国家民委重点实验室/中南民族大学生命科学学院,武汉430074
文献出处：
引用格式：
[1]夏涛;李梦飞;张雯;陈雪英;史银连;王红莹;李刚;祝伟-.魔芋软腐病病原菌果胶杆菌ZX67菌株全基因组测序及分析)[J].中国农学通报,2022(29):52-60
A类：
ZX67,胡萝卜果胶杆菌
B类：
魔芋,软腐病,全基因组测序,亚种,Pectobacterium,carotovorum,subsp,总长度,bp,编码基因,非编码,tRNA,rRNA,sRNA,转座子,前噬菌体,平均长度,CRISPR,寄主,主细胞,细胞壁,裂解酶,侵染,种蛋,分泌系统,防治方法
AB值：
0.277877
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