典型文献
过表达LncRNA IFNG-AS1急性淋巴细胞白血病细胞株的定量蛋白质组学分析
文献摘要：
目的 通过构建IFNG-AS1过表达细胞系,寻找促进急性淋巴细胞白血病(ALL)进展的长链非编码RNA(LncRNA)IFNG-AS1的潜在靶点.方法 采用IFNG-AS1过表达慢病毒和空载体组侵染ALL细胞系jurkat构建IFNG-AS1过表达的jurkat细胞,采用qRT-PCR方法检测两组细胞中IFNG-AS1的表达情况.采用高效液相色谱(HPLC)分离、串联质谱标记(TMT)定量蛋白质组学、液相色谱-质谱(LC-MS/MS)分析方法鉴定IFNG-AS1过表达jurkat细胞中差异表达蛋白(DEPs),并对其调控网络进行生物信息学分析,采用qRT-PCR对筛选的DEPs进行进一步验证.结果 IFNG-AS1过表达jurkat细胞中91个蛋白表达显著上调,50个蛋白表达显著下调.DEPs与细胞分裂和免疫调节相关,具有催化活性和离子结合功能,参与了多种重要的信号通路(PPAR信号通路和PI3K/AKt信号通路)、代谢通路、DNA复制的调控,在细胞组成、生物过程和分子功能等方面具有重要作用.qRT-PCR结果显示FSIP2、PYGM、TTLL1和LIMD2的表达升高最为显著,ATP2A1、ESCO2和DNMT3B的表达降低最为显著,与蛋白质组学结果一致.结论 LncRNA IFNG-AS1可影响jurkat细胞中多种蛋白的表达,且主要和TTLL1、PYGM相关.
文献关键词：
急性淋巴细胞白血病;LncRNA IFNG-AS1;定量蛋白质组学;差异蛋白表达
中图分类号：
作者姓名：
吴珊;蒋丹;徐广贤
作者机构：
宁夏医科大学临床医学院,银川 750004;广东医科大学医学技术学院医学检验系,东莞 523000
文献出处：
引用格式：
[1]吴珊;蒋丹;徐广贤-.过表达LncRNA IFNG-AS1急性淋巴细胞白血病细胞株的定量蛋白质组学分析)[J].宁夏医科大学学报,2022(05):479-486
A类：
jurkat,FSIP2,PYGM,TTLL1,LIMD2,ATP2A1,ESCO2
B类：
过表达,LncRNA,IFNG,AS1,急性淋巴细胞白血病,细胞株,定量蛋白质组学,组学分析,细胞系,ALL,长链非编码,潜在靶点,慢病毒,空载,侵染,qRT,HPLC,串联质谱,TMT,差异表达蛋白,DEPs,调控网络,生物信息学分析,细胞分裂,免疫调节,催化活性,离子结合,PPAR,PI3K,AKt,代谢通路,细胞组成,生物过程,DNMT3B,种蛋,差异蛋白表达
AB值：
0.207544
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