典型文献
lncRNA HULC对肝癌细胞miRNA差异表达谱及ceRNA调控网络的影响
文献摘要：
目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)肝癌高表达转录本(HULC)对肝癌细胞微小RNA(miRNA)差异表达谱及竞争内源性RNA(ceRNA)调控网络的影响.方法 选取人肝癌细胞系BEL-7402,瞬时转染HULC siRNA以降低lncRNA HULC的表达.通过高通量测序选取表达具有差异的miRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证.基于参考基因组,预测新miRNA.通过基因富集分析及ceRNA调控网络,研究这些基因的潜在功能.结果 经敲低lncRNA HULC表达后,通过高通量测序挑选出了9个表达差异显著的miRNA.5个miRNA表达下调,4个miRNA表达上调.通过miRDeep2打分,挑选出了15个分值较高的新miRNA.基因富集分析结果显示,表达下调的miRNA的靶基因的分子功能与丝氨酸tRNA连接酶活性、蛋白激酶活性、阳离子通道活性、钙转运ATP酶活性等有关;表达上调的miRNA的靶基因与硒代半胱氨酸裂解酶活性、过氧化物酶体机制靶向信号1结合、过氧化物酶体靶向序列结合、蛋白质N-末端结合、肿瘤坏死因子受体超家族结合等有关.miRNA-靶基因互作网络、显著富集功能-功能互作网络揭示靶基因与miRNA的关联性以及功能间的相关性.结论 在肝癌细胞系BEL-7402中lncRNA HULC具有调节多个表达差异的miRNA的作用,通过ceRNA调控网络模式,影响肝癌的发生、发展.
文献关键词：
长链非编码RNA;肝癌高表达转录本;肝细胞癌;高通量测序;微小RNA
中图分类号：
作者姓名：
关璐璐;韩松峰;李世朋;王梦姣;邵晓亚;乔兵兵;席守民
作者机构：
471000 洛阳,河南科技大学基础医学院医学科研中心;454000 河南,焦作市人民医院普外二区;450000 河南,郑州大学第一附属医院肝胆胰外科;471000 洛阳,河南省血栓与止血国际联合实验室
文献出处：
引用格式：
[1]关璐璐;韩松峰;李世朋;王梦姣;邵晓亚;乔兵兵;席守民-.lncRNA HULC对肝癌细胞miRNA差异表达谱及ceRNA调控网络的影响)[J].中国临床新医学,2022(05):403-409
A类：
miRDeep2
B类：
lncRNA,HULC,miRNA,差异表达,表达谱,ceRNA,调控网络,长链非编码,肝癌高表达转录本,内源性,人肝癌细胞,细胞系,BEL,转染,siRNA,基于参考,参考基因,基因富集分析,敲低,挑选出,表达差异,打分,靶基因,丝氨酸,tRNA,连接酶,蛋白激酶,激酶活性,阳离子,离子通道,钙转运,ATP,硒代半胱氨酸,裂解酶,过氧化物酶体,超家族,基因互作,互作网络,网络模式,肝细胞癌
AB值：
0.263202
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