典型文献
基于生物信息学及网络药理学分析丹皮酚抗瘢痕疙瘩的作用机制
文献摘要:
目的 筛选丹皮酚作用于瘢痕疙瘩(KD)的潜在药物靶点和信号通路,初步分析丹皮酚抗KD的作用机理.方法 从CTD和GeneCards数据库中获取KD致病基因,从TCMSP和PubChem数据库中获取丹皮酚直接靶标基因.采用STRING数据库和Cytoscape3.7.1软件进行网络拓扑分析,筛选出KD候选基因、丹皮酚候选靶点基因和丹皮酚的潜在药物靶点.利用DIVAD软件进行基因功能富集(GO)分析和信号通路富集(KEGG)分析,并采用Cytoscape软件构建药物靶点网络图.下载GEO芯片数据进行最佳药物靶点验证.结果 共筛选出KD候选基因143个、丹皮酚候选靶点基因29个,丹皮酚抗KD的潜在药物靶点11个,并构建出一个包含11个节点、86条边的潜在药物靶点PPI网络;这些潜在药物靶点与磷脂腺肌醇3激酶/蛋白质丝氨酸苏氨酸激酶(PI3K/Akt)信号通路、凋亡信号通路及核转录因子-κB(NF-κB)信号通路等相关.结论 丹皮酚可能通过作用于PI3K/Akt信号通路、凋亡通路及NF-κB信号通路中的核转录因子κB抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白、B细胞淋巴瘤-2、磷脂酶和张力蛋白同源物、转化生长因子β1、Akt1、丝裂原活化蛋白激酶1、白细胞介素-6、NF-κB1、纤维连接蛋白1、半胱氨酸蛋白酶3起到抗KD的作用.
文献关键词:
丹皮酚;瘢痕疙瘩;生物信息学;网络药理学
中图分类号:
作者姓名:
刘丽娜;杨锋
作者机构:
南华大学衡阳医学院附属第二医院整形外科,湖南省衡阳市421001
文献出处:
引用格式:
[1]刘丽娜;杨锋-.基于生物信息学及网络药理学分析丹皮酚抗瘢痕疙瘩的作用机制)[J].中南医学科学杂志,2022(03):362-366
A类:
DIVAD,磷脂酶和张力蛋白同源物
B类:
网络药理学,药理学分析,丹皮酚,瘢痕疙瘩,KD,潜在药物,药物靶点,初步分析,CTD,GeneCards,致病基因,TCMSP,PubChem,靶标基因,STRING,Cytoscape3,网络拓扑分析,候选基因,靶点基因,基因功能,功能富集,信号通路富集,软件构建,靶点网络,网络图,下载,GEO,点验,一个包,PPI,肌醇,蛋白质丝氨酸苏氨酸激酶,PI3K,核转录因子,凋亡通路,哺乳动物雷帕霉素靶蛋白,细胞淋巴瘤,转化生长因子,Akt1,丝裂原活化蛋白激酶,B1,纤维连接蛋白,半胱氨酸蛋白酶
AB值:
0.242325
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