典型文献
过敏性紫癜关键基因的生物信息学分析及中药治疗预测
文献摘要：
通过生物信息学对过敏性紫癜(HSP)的差异表达miRNA进行分析,探索其调控的基因、生物过程及代谢通路,进而预测治疗HSP的潜在中药组方.运用GEO数据库对原始数据集GSE80401进行差异分析,筛选出差异表达的miRNA,通过miRwalk、TargetScan、miRDB数据库预测靶基因,基于Metascape数据库进行基因本体(GO)和pathway富集分析,利用Cytoscape软件进行关键靶点筛选.最后将关键靶点与Coremine Medical数据库相互映射,筛选治疗HSP的潜在中药组方.基于GSE样本数据预测的靶基因共有83个,关键基因为hsa-miR-3945,GO富集分析结果涉及对脂多糖的反应、对无机物的反应、凋亡信号通路、对细胞外刺激的反应等生物过程,KEGG富集结果涉及IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化通路、NF-κB信号通路等.中药预测发现桂枝、茯苓、赤芍、桃仁、牡丹皮可作为潜在药物来治疗HSP.显著性差异基因和潜在核心靶点的分析研究促进了对HSP发病机制的进一步理解和探索,为中医药治疗HSP提供了新的方向和临床依据.
文献关键词：
过敏性紫癜;生物信息学;差异miRNA基因;hsa-miR-3945;中药预测
中图分类号：
作者姓名：
罗斐;袁颢宸;刁娟娟
作者机构：
山东中医药大学第一临床医学院,济南 250013;山东中医药大学附属医院,济南 250011
文献出处：
引用格式：
[1]罗斐;袁颢宸;刁娟娟-.过敏性紫癜关键基因的生物信息学分析及中药治疗预测)[J].激光生物学报,2022(02):165-172
A类：
GSE80401
B类：
过敏性紫癜,关键基因,生物信息学分析,中药治疗,HSP,差异表达,miRNA,生物过程,代谢通路,中药组方,GEO,原始数据,出差,miRwalk,TargetScan,miRDB,靶基因,Metascape,基因本体,pathway,富集分析,Cytoscape,关键靶点,靶点筛选,Coremine,Medical,互映,数据预测,hsa,脂多糖,无机物,集结,Th17,细胞分化,中药预测,桂枝,茯苓,赤芍,桃仁,牡丹皮,潜在药物,差异基因,核心靶点,中医药治疗
AB值：
0.362766
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