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典型文献
基于miRNA-mRNA调控网络筛选与验证参与Graves病B细胞增殖的关键基因
文献摘要:
目的:利用生物信息学筛选出Graves病(GD)患者外周血B细胞中差异表达的miRNA,构建miRNA-mRNA调控网络,为GD治疗提供新靶点.方法:采用微阵列技术检测初发GD患者和健康受试者外周血CD19+B细胞中miRNA和mRNA表达谱.利用TargetScan和miRBase数据库对差异miRNA的靶基因进行预测,与差异mRNA取交集,筛选出目的靶基因.构建miRNA-mRNA差异表达网络,对其进行GO注释分析,筛选出与B细胞增殖相关的mRNA并采用荧光定量PCR(qRTPCR)以及流式细胞术(FACS)等手段进行验证.结果:GD患者外周血CD19+B细胞中有119个差异表达miRNA和572个差异表达mRNA,并筛选到159个潜在靶基因.通过构建miRNA-mRNA差异表达网络以及GO注释分析等手段,证实与B细胞增殖相关的CD79B在GD患者外周血CD19+B细胞中表达升高.qRT-PCR和FACS验证得出GD患者外周血CD19+B细胞中CD79BmRNA和蛋白水平均显著上调(P<0.01).对调控CD79B的miRNA富集并进行qRF-PCR验证,结果显示GD患者外周血CD19+B细胞中hsa-miR-146b-5p表达显著下调(P<0.001).利用TargetScan数据库预测发现CD79B mRNA的3'端非编码区存在潜在的hsa-miR-146b-5p结合位点.结论:GD患者外周血B细胞中hsa-miR-146b-5p的下调可能促进CD79B上调,引起B细胞活化与增殖.CD79B有望成为GD新的生物标志物和治疗的潜在靶点.
文献关键词:
Graves病;B细胞;miRNA;CD79B;微阵列
作者姓名:
王玮;杨倩;王凯;钟惠敏;潘凡凡;查兵兵
作者机构:
复旦大学附属上海市第五人民医院内分泌科,上海200240
文献出处:
引用格式:
[1]王玮;杨倩;王凯;钟惠敏;潘凡凡;查兵兵-.基于miRNA-mRNA调控网络筛选与验证参与Graves病B细胞增殖的关键基因)[J].中国免疫学杂志,2022(22):2770-2776
A类:
qRTPCR,CD79BmRNA,qRF
B类:
miRNA,调控网络,Graves,关键基因,利用生物,GD,差异表达,新靶点,微阵列,初发,健康受试者,CD19+B,表达谱,TargetScan,miRBase,靶基因,交集,流式细胞术,FACS,hsa,146b,5p,非编码区,结合位点,细胞活化,生物标志物,潜在靶点
AB值:
0.193753
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