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木豆响应低温胁迫差异表达基因分析
文献摘要：
为探讨木豆[Cajanus cajan(L.)Millsp.]响应低温胁迫的机制,本研究以1份耐低温(MD)和1份低温敏感(QZ)木豆为试验材料,经4℃低温胁迫处理后进行RNA-seq测序分析,结果表明:2份木豆RNA-seq获得了丰富的转录本信息,对转录因子和差异表达基因的基因功能进行注释.木豆响应响应低温胁迫的转录因子主要包括MYB,AP2-EREBP等;在两份材料中,GO分析发现DEGs注释在细胞组成中"膜"和生物学过程中"细胞过程",KEGG分析均显著富集在"核糖体"通路中,而MD中还显著富集在植物激素信号转导、昼夜节律-植物等通路.通过两份材料对比,在MD材料中发现特有与耐低温相关的150个DEGs,主要为α-1,4-葡萄糖苷酶,参与碳水化合物、脂质代谢等途径.还筛选37个与耐寒相关重要差异表达基因和14条通路,并对10个DEGs进行qRT-PCR验证.本文从分子水平阐述了木豆低温胁迫下的响应机制,为未来木豆的抗寒育种奠定了理论基础.
文献关键词：
木豆;低温胁迫;转录组;转录因子;差异基因
中图分类号：
作者姓名：
唐军;丁西朋;陈志坚;马向丽;毕玉芬;郭凤根
作者机构：
云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室,海南海口 571101
文献出处：
引用格式：
[1]唐军;丁西朋;陈志坚;马向丽;毕玉芬;郭凤根-.木豆响应低温胁迫差异表达基因分析)[J].草地学报,2022(07):1701-1711
A类：
Millsp
B类：
木豆,低温胁迫,差异表达基因分析,Cajanus,cajan,耐低温,MD,温敏,QZ,胁迫处理,seq,测序分析,转录本,基因功能,MYB,AP2,EREBP,两份,DEGs,细胞组成,生物学过程,核糖体,植物激素,激素信号,信号转导,昼夜节律,材料对比,葡萄糖苷酶,碳水化合物,脂质代谢,耐寒,qRT,分子水平,响应机制,抗寒,育种,转录组,差异基因
AB值：
0.372162
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