典型文献
食管胃结合部腺癌生物信息学分析及Involucrin基因突变位点筛选
文献摘要：
目的 检测食管胃结合部腺癌(AEG)患者基因突变情况,分析内披蛋白(IVL)突变对肿瘤细胞生物学功能的影响.方法 将22例山西地区食管胃结合部腺癌患者的癌组织和癌旁组织进行全外显子组测序,分析IVL的突变情况并筛选IVL突变位点;整理汇总TCGA数据库中食管癌IVL的突变情况,进行GO功能注释和KEGG富集分析.构建IVL过表达质粒,转染食管癌细胞系KYSE150,测定细胞的增殖和迁移能力.体外合成不同突变位点的IVL寡肽,通过体外活性测试分析寡肽与转谷氨酰胺酶1(TGase1)的结合能力.结果 测序结果发现在食管胃结合部腺癌中IVL有5处突变;GO分析显示IVL突变与上皮细胞分化、细胞分化调控的活性等生物学过程有关;KEGG信号通路分析显示IVL突变与cAMP信号通路等途径有关.过表达IVL可抑制食管癌细胞的增殖和迁移能力(P<0.05).突变型IVL寡肽与TGase1的结合能力弱于野生型寡肽(P<0.05).结论 IVL重复基序第7位氨基酸的突变减弱IVL与TGase1的结合,影响多种与肿瘤相关的生物学过程和信号通路.
文献关键词：
食管胃结合部腺癌;内披蛋白;基因突变
中图分类号：
作者姓名：
吕雪;李雪薇;杨婷;郑锦秀;祝子鹤;杨涛;徐钧
作者机构：
山西医科大学生物化学与分子生物学教研室,山西 太原030001;山西医科大学药理学教研室,山西 太原030001;山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室,山西 太原030001;山西医科大学第一医院 肝胆胰外科,山西 太原030001
文献出处：
引用格式：
[1]吕雪;李雪薇;杨婷;郑锦秀;祝子鹤;杨涛;徐钧-.食管胃结合部腺癌生物信息学分析及Involucrin基因突变位点筛选)[J].基础医学与临床,2022(02):235-242
A类：
Involucrin,TGase1
B类：
食管胃结合部腺癌,生物信息学分析,基因突变位点,AEG,内披蛋白,IVL,肿瘤细胞,细胞生物学功能,山西地区,癌组织,癌旁组织,全外显子组测序,TCGA,功能注释,富集分析,过表达质粒,转染,食管癌细胞系,KYSE150,细胞的增殖,增殖和迁移,迁移能力,寡肽,体外活性,测试分析,转谷氨酰胺酶,结合能,处突,上皮细胞,细胞分化调控,生物学过程,通路分析,cAMP,可抑制,突变型,野生型,基序,肿瘤相关
AB值：
0.242435
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