典型文献
甲基化CpG结合蛋白2的泛癌分析及其对肝癌Hep3B细胞生物活性的影响
文献摘要：
目的 应用生物信息学方法分析甲基化CpG结合蛋白2(methyl-CpG-binding domain protein 2,MeCP2)在多种肿瘤中的作用并在肝癌细胞中对其进行验证.方法 利用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource 2.0,TIMER2.0)、基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2,GEPIA 2)和癌症基因组学门户网站(cBioPortal for Cancer Genomics,cBioPortal)分析MeCP2基因在多种肿瘤组织中的表达,MeCP2对肿瘤患者生存期的影响及其在肿瘤中遗传变异的情况.应用CCK-8及细胞周期实验分别检测过表达和沉默MeCP2对肝癌Hep3B细胞增殖及细胞周期的影响.结果 TIMER2.0显示,与正常组织相比,MeCP2在乳腺浸润癌、胆管癌、食管癌、头颈鳞状细胞癌、肾嫌色细胞癌、肝细胞癌中的mRNA表达水平显著增加(P<0.05);GEPIA2结果显示MeCP2与乳腺浸润癌、结肠癌、肾乳头状细胞癌、肝细胞癌、肾透明细胞癌、葡萄膜黑色素瘤的预后相关.cBioPortal分析提示错义突变是MeCP2基因突变的主要类型.CCK-8实验表明过表达MeCP2可促进肝癌Hep3B细胞增殖(P<0.05),而抑制其表达可抑制肝癌Hep3B细胞增殖(P<0.01);细胞周期实验表明抑制MeCP2可将肝癌Hep3B细胞阻滞在G1期(P<0.01).结论 MeCP2在肝癌中可能发挥癌基因的作用.
文献关键词：
MeCP2;生物信息学;肝癌;增殖
中图分类号：
作者姓名：
杨阳;孙瑞芳;李玉龙;孙娜
作者机构：
陕西中医药大学公共卫生学院卫生毒理学教研室,咸阳 712046;西安交通大学基础医学院病理学系;陕西省人民医院消化内科
文献出处：
引用格式：
[1]杨阳;孙瑞芳;李玉龙;孙娜-.甲基化CpG结合蛋白2的泛癌分析及其对肝癌Hep3B细胞生物活性的影响)[J].山西医科大学学报,2022(09):1047-1052
A类：
B类：
甲基化,CpG,结合蛋白,泛癌分析,Hep3B,细胞生物活性,生物信息学方法,methyl,binding,domain,protein,MeCP2,肝癌细胞,肿瘤免疫,免疫评估,Tumor,Immune,Estimation,Resource,TIMER2,基因表达谱,交互分析,Gene,Expression,Profiling,Interactive,Analysis,癌症基因,基因组学,学门,门户网站,cBioPortal,Cancer,Genomics,肿瘤组织,肿瘤患者,生存期,遗传变异,CCK,细胞周期,过表达,正常组织,胆管癌,食管癌,头颈鳞状细胞癌,肾嫌色细胞癌,肝细胞癌,GEPIA2,结肠癌,肾乳头状细胞癌,肾透明细胞癌,葡萄膜黑色素瘤,错义突变,基因突变,主要类型,可抑制,G1,癌基因
AB值：
0.382991
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