首站-论文投稿智能助手
典型文献
甜樱桃PavMYC2基因克隆与表达分析
文献摘要:
[目的]克隆甜樱桃PavMYC2基因并研究其表达模式,为深入研究其在花芽响应温度逆境中的功能奠定基础.[方法]从甜樱桃基因组数据库中获得PavMYC2基因的序列,对该基因进行生物信息学分析和亚细胞定位;通过qRT-PCR技术探究PavMYC2基因在甜樱桃不同组织及花芽各个时期的表达模式;运用双分子荧光互补实验(BiFC)检测其与PavJAZ蛋白的互作关系;结合前人转录组结果分析PavJAZ的季节表达模式.[结果]PavMYC2编码689个氨基酸,具有bHLH-Zip保守结构域,属于bHLH家族.亚细胞定位结果表明,该基因在细胞核中发挥功能.进化树结果表明,甜樱桃PavMYC2与中国樱桃(Prunus pseudocerasus)和樱花(Prunus yedoensis)亲缘关系最近.实时荧光定量PCR结果分析发现,PavMYC2的表达具有组织特异性,在花芽中表达量最高,依次是叶、茎、花、根中表达量的4.8、4.9、8.8、37.4倍.在花芽中,PavMYC2的表达量在夏秋季高,然后逐渐降低,在冬季维持一定的表达水平,春季时最低.顺式作用元件分析发现,该基因启动子上含有大量光响应元件、多种激素响应元件和低温胁迫等相关元件.互作蛋白结果显示,PavMYC2可以与PavJAZ1/2/3蛋白发生互作,进一步对JAZs基因的表达模式进行分析,发现PavJAZ1/2/3/5与PavMYC2的表达量变化相似.[结论]克隆得到1个PavMYC2基因,夏秋季高温时期在花芽中高表达,随后逐渐降低,在冬季维持一定的表达水平,春季开花时最低.其与PavJAZ1/2/3互作,协同响应温度胁迫.该研究为进一步探究甜樱桃花芽中MYC2在响应温度胁迫和调控开花进程中的作用奠定了基础.
文献关键词:
甜樱桃;花芽;温度胁迫;MYC2
作者姓名:
王继源;王丽;纠松涛;孙菀霞;徐岩;刘勋菊;张才喜
作者机构:
上海交通大学农业与生物学院,上海200240
文献出处:
引用格式:
[1]王继源;王丽;纠松涛;孙菀霞;徐岩;刘勋菊;张才喜-.甜樱桃PavMYC2基因克隆与表达分析)[J].果树学报,2022(05):701-711
A类:
PavMYC2,PavJAZ,PavJAZ1,JAZs
B类:
甜樱桃,基因克隆与表达,表达分析,表达模式,花芽,逆境,基因组数据,生物信息学分析,亚细胞定位,qRT,技术探究,不同组织,双分子荧光互补实验,BiFC,互作关系,转录组,bHLH,Zip,保守结构域,定位结果,细胞核,进化树,中国樱桃,Prunus,pseudocerasus,樱花,yedoensis,亲缘关系,有组织,组织特异性,夏秋季,顺式作用元件,基因启动子,光响应,响应元,激素响应,低温胁迫,关元,互作蛋白,白发,开花,花时,温度胁迫,樱桃花
AB值:
0.271066
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。