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基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因
文献摘要：
以巨菌草(Pennisetum giganteum)的叶片、茎、根为试验材料,通过分析8个基因18s rRNA、Actin、GAPDH、ACTB、EF-1α、UBQ、CYP、TUB在正常生长、干旱以及盐碱胁迫下荧光定量PCR中稳定性表达情况,筛选巨菌草的稳定内参基因.利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件计算内参基因的表达稳定值并进行排序,最终通过赋值法综合排序确定稳定内参基因.结果表明,内参基因的稳定性在不同处理下存在差异.其中,ACTB稳定性好,为本研究筛选出巨菌草的内参基因.本研究筛选出的内参基因,为后续巨菌草功能基因表达分析奠定了基础.
文献关键词：
巨菌草;实时荧光定量PCR;内参基因;稳定性评价;干旱胁迫;盐碱胁迫;赋值法综合排序
中图分类号：
作者姓名：
李苏涛;李妍;张磊;陈思齐;韩雪林;张娟;苏德伟;罗海凌;周晶
作者机构：
福建农林大学动物科学学院(蜂学学院), 福建 福州 350002;福建农林大学国家菌草工程技术研究中心, 福建 福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]李苏涛;李妍;张磊;陈思齐;韩雪林;张娟;苏德伟;罗海凌;周晶-.基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因)[J].草业科学,2022(05):907-921
A类：
赋值法综合排序
B类：
巨菌草,内参基因,Pennisetum,giganteum,18s,rRNA,Actin,GAPDH,ACTB,EF,UBQ,CYP,TUB,盐碱胁迫,geNorm,NormFinder,BestKeeper,软件计算,不同处理,下存,功能基因,基因表达分析,稳定性评价,干旱胁迫
AB值：
0.299906
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