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典型文献
干旱胁迫下蒙农杂种冰草RT-qPCR内参基因的筛选
文献摘要:
为了筛选出蒙农杂种冰草基因表达分析研究的最适内参基因,基于前期蒙农杂种冰草转录组数据(NCBI临时登录号:PRJNA777813),以不同干旱胁迫下蒙农杂种冰草茎和叶2个器官为材料,用RT-qPCR技术分析6个候选内参基因(CYP、GAPDH、G6PD、UBQ11、ACT11和TUB4)的表达情况,并利用Ct值和3个软件分析候选内参基因的表达稳定性.Ct值分析结果表明,6个候选内参基因在干旱胁迫下蒙农杂种冰草茎和叶中的Ct值为24~35,表达丰度适中,适合进行下一步筛选.geNorm、NormFinder及ReFinder综合分析后结果表明,GAPDH是干旱胁迫下蒙农杂种冰草不同器官基因表达分析的最佳内参基因,TUB4次之,CYP最差.为了提高准确性,干旱胁迫下蒙农杂种冰草也可同时使用两个内参基因组合,GAPDH和G6PD是最稳定的内参基因组合.
文献关键词:
蒙农杂种冰草;内参基因;实时荧光定量PCR
作者姓名:
王晓宇;刘秉毅;詹圆;伏兵哲;米福贵;张志强
作者机构:
内蒙古农业大学草原与资源环境学院/草地资源教育部重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010011;宁夏大学农学院/宁夏草牧业工程技术研究中心,宁夏 银川 750021;内蒙古农业大学草原与资源环境学院/国家林业草原北方抗旱耐寒草品种育繁工程技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010011
文献出处:
引用格式:
[1]王晓宇;刘秉毅;詹圆;伏兵哲;米福贵;张志强-.干旱胁迫下蒙农杂种冰草RT-qPCR内参基因的筛选)[J].中国草地学报,2022(08):1-8
A类:
蒙农杂种冰草,PRJNA777813,UBQ11,ACT11,TUB4,ReFinder
B类:
干旱胁迫,qPCR,内参基因,基因表达分析,转录组数据,NCBI,登录号,CYP,GAPDH,G6PD,Ct,表达稳定性,适中,geNorm,NormFinder,不同器官,基因组合
AB值:
0.145297
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