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新疆旱獭肠道RNA病毒的宏转录组学研究
文献摘要：
目的 了解新疆地区旱獭(Marmota)肠道携带RNA病毒的病原本底.方法 采用宏转录组学方法对新疆喀什地区14只健康旱獭肠道样品进行病毒组分析.结果 基于重叠序列(contig)水平共注释到5个脊椎动物病毒科,分别为星状病毒科、小RNA病毒科、呼肠孤病毒科、圆环病毒科和腺病毒科.根据病毒宏转录组学结果,对注释到的病毒进行检测与进化分析,发现心病毒、嵴病毒、摩萨病毒与参考毒株同源性较高,为这些病毒变异株,而肠道病毒、腺病毒与已知病毒具有明显的遗传差异,可能为该病毒新种;星状病毒与其他旱獭源星状病毒之间氨基酸同源性差异较大,显示星状病毒在旱獭体内具有遗传多样性.值得注意的是,旱獭轮状病毒与牛轮状病毒核苷酸同源性高达92％,表明该病毒可能经过粪口途径实现跨种传播.结论 该研究揭示了旱獭肠道携带RNA病毒的多样性,为了解旱獭病毒本底、监测病毒传播生态链提供了重要数据.
文献关键词：
新疆;旱獭属;宏转录组学;RNA病毒;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
颜广智;孙悦;闫晓敏;陈俊杰;赵梓含;屈勇刚;涂长春;黄良宗;何彪
作者机构：
佛山科学技术学院生命科学与工程学院,广东佛山 528000;中国农业科学院长春兽医研究所,长春 130122;石河子大学动物科技学院,新疆石河子 832003
文献出处：
引用格式：
[1]颜广智;孙悦;闫晓敏;陈俊杰;赵梓含;屈勇刚;涂长春;黄良宗;何彪-.新疆旱獭肠道RNA病毒的宏转录组学研究)[J].军事医学,2022(07):534-539
A类：
旱獭属
B类：
宏转录组学,组学研究,新疆地区,Marmota,本底,新疆喀什,喀什地区,病毒组,contig,脊椎动物,动物病毒,星状病毒,呼肠孤病毒,圆环病毒,腺病毒科,进化分析,萨病,毒株,同源性,病毒变异株,肠道病毒,遗传差异,新种,遗传多样性,值得注意,牛轮状病毒,粪口途径,跨种传播,病毒传播,传播生态,生态链,重要数据
AB值：
0.285464
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