典型文献
宁夏一株人呼吸道合胞病毒B亚型全基因组基因特征分析
文献摘要：
目的 了解2020年宁夏地区人群常见呼吸道病毒感染分布情况,对一株人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)宁夏株进行全基因组测序,对其进行基因型别鉴定及基因进化分析.方法 选取2020年宁夏新冠肺炎疫情期间具有呼吸道感染症状的480人作为研究对象,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(real time reverse transcription polymerase chain reaction,real time RT-PCR)方法对甲型流感病毒(FluA)、乙型流感病毒(FluB)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(PIV)Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、呼吸道腺病毒(RAdV)、人偏肺病毒(HMPV)等8种呼吸道病原进行检测.对筛选出的HRSV进行全基因组测序,测序结果经分子生物学软件拼接,与GenBank中相关代表株序列进行分子进化分析.结果 检出呼吸道病毒51例,阳性率为10.6%,RSV检出率最高(4.0%)(19/480).宁夏首株China/ningxia/2020-02的全基因组序列为15259 bp核苷酸,与RSV-A亚型原型株Long株的核苷酸同源性最低为80.9%,与RSV-B亚型原型株9320株的核苷酸同源性为96.0%,提示了宁夏首株HRSV为B亚型.G基因遗传进化树表明,该毒株与BA9基因型代表株聚集在同一分支上,划分为BA9基因型.结论 新型冠状病毒肺炎流行期间,应加强呼吸道病毒的监测,对人呼吸道合胞病毒的全基因组测序研究,有必要连续监测本地区RSV亚型流行趋势,为预防和控制RSV感染提供指导,为筛选疫苗株提供参考.
文献关键词：
呼吸道病毒;人呼吸道合胞病毒;B亚型;基因组序列分析
中图分类号：
作者姓名：
王新宁;吴忠兰;李宗倍;吴玉灵;苏艳艳;马学平
作者机构：
宁夏医科大学公共卫生与管理学院;宁夏环境因素与慢性病控制重点实验室,银川 750004;宁夏疾病预防控制中心,银川 750004
文献出处：
引用格式：
[1]王新宁;吴忠兰;李宗倍;吴玉灵;苏艳艳;马学平-.宁夏一株人呼吸道合胞病毒B亚型全基因组基因特征分析)[J].宁夏医科大学学报,2022(09):886-891,912
A类：
RAdV,ningxia
B类：
一株,人呼吸道合胞病毒,基因特征分析,宁夏地区,呼吸道病毒感染,感染分布,human,respiratory,syncytial,virus,HRSV,全基因组测序,基因型别,基因进化,进化分析,新冠肺炎疫情期间,呼吸道感染,感染症状,逆转录聚合酶链反应,real,reverse,transcription,polymerase,chain,reaction,甲型流感病毒,FluA,乙型流感病毒,FluB,副流感病毒,PIV,腺病毒,人偏肺病毒,HMPV,呼吸道病原,分子生物学,拼接,GenBank,代表株,分子进化,China,全基因组序列,bp,Long,同源性,基因遗传,遗传进化树,毒株,BA9,流行期间,连续监测,流行趋势,预防和控制,疫苗株,基因组序列分析
AB值：
0.292226
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