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云南省大理市啮齿动物携带冠状病毒和戊型肝炎病毒的调查
文献摘要：
目的 调查云南省大理市啮齿动物冠状病毒(Coronavirus,CoV)和戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus,HEV)感染率.方法 2020年8月～2021年8月在大理市4个乡镇采集啮齿动物样本,采用巢式PCR扩增CoV和HEV的保守序列基因,用生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析.结果 共捕获76只啮齿动物属于5属6种,CoV感染动物为褐家鼠(Rattus norvegicus)和黄胸鼠(Rattus tanezumi),感染率分别为 40.74％(11/27)、2.38％(1/42);HEV 感染动物为褐家鼠和黄胸鼠,感染率分别为14.81％(4/27)、2.38％(1/42).在银桥镇捕获的2只褐家鼠中同时检测到CoV和HEV,感染率为7.41％(2/27).基于 CoV 的部分 RNA 依赖的 RNA 酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)的 434 bp 核苷酸片段分析,11 株CoV阳性样本均来 自褐家鼠,为α-CoV,与来 自 中国福建黄毛鼠(Rattus losea)RtRl/FJ2015同源性最高,为99.73％～99.74％;1株CoV阳性样本来自黄胸鼠,为β-CoV,与来自中国云南板齿鼠(Bandicota indica)Ruili66同源性最高,为98.21％.基于HEV的部分RdRp的340 bp核苷酸片段分析,5株HEV阳性样本均来自褐家鼠,均为HEV-C,与来自中国香港免疫移植病人pt 5株同源性最高,为95.87％～96.21％.结论 云南省大理市啮齿动物中存在CoV和HEV感染,2种病毒的宿主动物与人关系密切,应加强相关病毒的监测与研究.
文献关键词：
冠状病毒;戊型肝炎病毒;共同感染;啮齿动物
中图分类号：
作者姓名：
杨字;殷红敏;黄皓;孔逸尘;陈利;张云智
作者机构：
大理大学公共卫生学院,大理大学预防医学研究所,云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室(培育),云南省高校人兽共患病跨境防控与检疫重点实验室,大理671000;昆明医科大学公共卫生学院,昆明650500
文献出处：
引用格式：
[1]杨字;殷红敏;黄皓;孔逸尘;陈利;张云智-.云南省大理市啮齿动物携带冠状病毒和戊型肝炎病毒的调查)[J].中国人兽共患病学报,2022(08):685-692
A类：
norvegicus,tanezumi,losea,RtRl,FJ2015,Bandicota,Ruili66
B类：
大理市,啮齿动物,戊型肝炎病毒,动物冠状病毒,Coronavirus,CoV,Hepatitis,Virus,HEV,感染率,动物样本,保守序列,生物信息学软件,行同,同源性,遗传进化分析,褐家鼠,Rattus,黄胸鼠,桥镇,同时检测,dependent,polymerase,RdRp,bp,阳性样本,黄毛鼠,indica,中国香港,pt,宿主动物,监测与研究,共同感染
AB值：
0.243635
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