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质粒基因注释可视化系统VPA V1.0的研建
文献摘要：
目的 建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布.方法 运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本VPA.pl.结果 构建了质粒基因注释可视化系统VPA,该系统可实现多种类别、不同长度质粒的基因注释可视化显示,展示信息丰富全面、操作简单便捷.结论 VPA系统可适用于目前细菌研究中常见的大部分质粒基因注释工作,为细菌的比较基因组学和结构基因组学提供了更直观的图像展示,并为其他相关可视化系统的开发提供了参考模型.
文献关键词：
VPA系统;质粒;基因注释;可视化
中图分类号：
作者姓名：
穆凯;孙岩松;周冬生;赵月峨;杨慧盈;殷喆;王鹏
作者机构：
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京 100071
文献出处：
引用格式：
[1]穆凯;孙岩松;周冬生;赵月峨;杨慧盈;殷喆;王鹏-.质粒基因注释可视化系统VPA V1.0的研建)[J].军事医学,2022(03):167-172
A类：
B类：
质粒,基因注释,可视化系统,VPA,V1,临床医学研究,易用,观展,基因分布,Perl,文件配置,色系,系统模块,图形生成,成模,出错,脚本,pl,同长,可视化显示,比较基因组学,结构基因,更直,参考模型
AB值：
0.373581
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