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成都市人源沙门菌基因组特征分析
文献摘要：
目的 基于全基因组测序技术,探究成都市人源沙门菌的基因组特征,为监测与预防沙门菌感染提供资料.方法 收集35株成都市人源沙门菌(分离自腹泻患者粪便)进行全基因组测序.根据测序数据,进行血清型预测、耐药基因及可移动遗传元件预测、毒力因子注释及分布分析.结果 35株沙门菌分离株经全基因组测序,共预测到5种血清型,包括15株I4,[5],12:i:-沙门菌(13株为ST34、2株为新ST型)、12株鼠伤寒沙门菌(ST19)、5株肠炎沙门菌(ST11)、2株德比沙门菌(ST40)与1株火鸡沙门菌(ST463).35株沙门菌分离株共预测到10类42种不同的耐药基因,其中氨基糖苷类aac(6')-Iaa携带率为100％(35/35).I 4,[5],12:i:-沙门菌的耐药基因、质粒及插入序列数 目及种类多于其他血清型菌株.I 4,[5],12:i:-、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的毒力因子数目大于其他血清型菌株.部分鼠伤寒沙门菌有更高的毒力质粒、质粒编码菌毛和血清抗性毒力因子分布.结论 成都市人源沙门菌不同血清型菌株之间耐药基因、可移动遗传元件、毒力因子分布差异明显,值得在转录组、蛋白组进一步探究其耐药与毒力机制.
文献关键词：
沙门菌;全基因组测序;耐药基因;毒力特征
中图分类号：
作者姓名：
肖颖;武雅婷;赵婉妤;崔学文;黎明;许欣
作者机构：
四川大学华西公共卫生学院/华西第四医院,成都610041;广西壮族自治区卫生监督所,南宁 530021;四川省药品检验研究院,成都 611731;成都市疾病预防控制中心,成都 610041
文献出处：
引用格式：
[1]肖颖;武雅婷;赵婉妤;崔学文;黎明;许欣-.成都市人源沙门菌基因组特征分析)[J].中国人兽共患病学报,2022(05):433-440,446
A类：
ST463,Iaa
B类：
成都市,都市人,基因组特征,全基因组测序,防沙,沙门菌感染,腹泻患者,患者粪便,序数,行血,血清型,耐药基因,可移动遗传元件,毒力因子,分离株,I4,ST34,鼠伤寒沙门菌,ST19,肠炎沙门菌,ST11,德比,ST40,火鸡,鸡沙门菌,氨基糖苷类,aac,携带率,质粒,插入序列,菌毛,分布差异,转录组,蛋白组,毒力特征
AB值：
0.256188
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