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隆林牛与郏县红牛线粒体DNA全基因组遗传多样性比较研究
文献摘要：
[目的]本研究旨在从基因组水平探究隆林牛和郏县红牛的线粒体DNA(mtDNA)全基因组遗传多样性与母系起源,并对2个黄牛品种的mtDNA全基因组遗传多样性进行比较分析.[方法]采用全基因组重测序及生物信息学方法.[结果]在15头隆林牛和28头郏县红牛mtDNA全基因组序列中,共检测到36种单倍型,其中郏县红牛有26种单倍型,隆林牛仅有8种单倍型,2个黄牛品种共享2种单倍型.郏县红牛和隆林牛的平均单倍型多样度(Hd)分别为1.000和0.943,平均核苷酸多样度(Pi)分别为0.0080和0.0053,表明其遗传多样性丰富.构建的系统发育树表明,隆林牛和郏县红牛具有瘤牛和普通牛两个母系支系.[结论]隆林牛以瘤牛起源为主,郏县红牛为普通牛与瘤牛的混合起源,这2个地方黄牛品种具有独特的母系遗传信息,表现出明显的母系遗传差异.
文献关键词：
隆林牛;郏县红牛;mtDNA全基因组;遗传多样性;母系起源
中图分类号：
作者姓名：
宣泽义;陈嘉磊;陈少梅;易显凤;文信旺;肖正中;汪燕玲;雷初朝
作者机构：
广西壮族自治区畜牧研究所,南宁530001;西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100;广西家畜遗传改良重点实验室,南宁530001
文献出处：
引用格式：
[1]宣泽义;陈嘉磊;陈少梅;易显凤;文信旺;肖正中;汪燕玲;雷初朝-.隆林牛与郏县红牛线粒体DNA全基因组遗传多样性比较研究)[J].中国牛业科学,2022(03):1-5
A类：
隆林牛
B类：
郏县红牛,遗传多样性,mtDNA,母系起源,全基因组重测序,生物信息学方法,全基因组序列,单倍型,Hd,Pi,系统发育树,瘤牛,支系,地方黄牛,遗传信息,遗传差异
AB值：
0.136823
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