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典型文献
利用微卫星分析康西草原马匹种群的遗传多样性和群体结构
文献摘要:
旨在揭示康西草原马匹的品种来源以及群体遗传结构.本研究采集了当地60匹健康状况良好、体重适中、3~6岁之间不区分公母马的血液样品,试验分为6个种群并以纯血马等4个国外马品种、1个我国地方马品种作为对照,通过设计引物并提取基因组DNA结合微卫星扩增法对染色体上12个微卫星位点的等位基因进行检测,并对各种群遗传多样性参数、群体分化指数、瓶颈效应以及群体结构进行分析.试验按照群体个数为依据分为6组,每组1个重复,每个重复以该组样本量为标准.分析6个种群马的遗传参数结果表明,其中共检测到221个等位基因,平均Shannon指数为1.691;有效等位基因数(Ne)为3.649~5.397;期望杂合度(He)为0.681~0.798;观测杂合度(Ho)为0.632~0.780;平均多态信息含量(PIC)为0.643~0.772.这些结果表明,6个群体都具有很高的遗传多样性.通过微卫星DNA位点的连锁不平衡及哈迪-温伯格平衡分析发现,大多数位点的P值都大于校正值(P=0.006 5),表示较多位点都处于哈迪-温伯格及连锁平衡状态.各群体间群体分化系数(Fst)表明,群体间分化程度较低(Fst<0.15).基于Nei's遗传距离与地理距离之间Mantel相关性检验显示二者之间呈现正相关性(R=0.502),但未达到显著水平(P=0.310);各马匹种群瓶颈效应分析表明,P值极显著(P(IAM)<0.01)说明该地区的马群体受到过瓶颈效应的影响且该马群体历史上数量有大规模的减少.通过FCA因子分析、基于Nei's标准遗传距离UPGMA树状图以及Structure贝叶斯聚类分析发现,该地区马种群与纯血马和温血马聚为一类,说明该种群最有可能主要来源于温血马和纯血马.这些结果揭示,康西草原地区马匹具有较高的遗传多样性,该地马群体的血统与纯血马和温血马相近,这为当地马遗传资源评估以及开发利用打下了坚实的基础.
文献关键词:
康西草原马群体;微卫星DNA标记;群体结构;遗传多样性;品种来源
作者姓名:
康周才让;刘宇;王敏;李颖;毕晓昆;李媛媛;凌遥;赵春江
作者机构:
中国农业大学动物科技学院,北京100193;中国农业大学马研究中心,北京100193
文献出处:
引用格式:
[1]康周才让;刘宇;王敏;李颖;毕晓昆;李媛媛;凌遥;赵春江-.利用微卫星分析康西草原马匹种群的遗传多样性和群体结构)[J].畜牧兽医学报,2022(05):1431-1441
A类:
康西草原,种群瓶颈,康西草原马群体
B类:
利用微,微卫星分析,马匹,群体结构,品种来源,群体遗传结构,状况良好,适中,公母,母马,纯血马,引物,星位,等位基因,种群遗传,遗传多样性参数,群体分化,瓶颈效应,该组,样本量,遗传参数,Shannon,杂合度,He,Ho,多态信息含量,PIC,连锁不平衡,哈迪,温伯格,平衡分析,数位,正值,多位点,平衡状态,群体间,Fst,分化程度,Nei,遗传距离,地理距离,Mantel,相关性检验,显著水平,IAM,群体历史,上数,FCA,UPGMA,树状图,Structure,该种,草原地区,血统,遗传资源,资源评估
AB值:
0.351795
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