典型文献
基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选
文献摘要：
以枇杷品系春花(具有腋芽成花特性)和品种'火炬'(不具有腋芽成花特性)为试验材料,利用RNA-seq技术对枇杷腋芽进行转录组测序,以期筛选出调控枇杷腋芽成花的关键基因.结果表明:共鉴定到66 197条差异表达基因,其中上调表达基因主要集中在2月27日-4月8日;维恩图分析显示,不同取样点共同上调表达的基因有160个,共同下调表达的基因有198个.差异表达基因GO功能注释到3个大类(生物过程、细胞组分和分子功能)的48个功能组,KEGG通路显著性富集分析表明,差异基因主要被注释到20个途径上,富集于植物激素信号传导、淀粉和糖代谢、苯基丙烷代谢、植物-病原体互作反应和谷胱甘肽代谢等途径.经功能注释后,最终从腋芽转录组筛选到32个成花基因、1个ABA受体基因PYLA、1个ABA脱氢酶基因ABH4和大量功能未知的新基因,这些基因可能在枇杷腋芽成花途径中起重要作用.本研究有助于更好地了解枇杷腋芽成花过程中的基因转录水平,也可为进一步解析枇杷腋芽成花的分子遗传机制奠定基础.
文献关键词：
枇杷;腋芽成花;转录组分析
中图分类号：
作者姓名：
章加应;肖海涛;张学英;安海山;徐芳杰;周博强
作者机构：
上海市农业科学院林木果树研究所,上海201403;上海应用技术大学生态技术与工程学院,上海201418
文献出处：
引用格式：
[1]章加应;肖海涛;张学英;安海山;徐芳杰;周博强-.基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选)[J].上海农业学报,2022(06):47-57
A类：
腋芽成花,PYLA,ABH4
B类：
转录组测序,枇杷,品系,春花,火炬,seq,出调,关键基因,差异表达基因,维恩图,同上,同下,功能注释,生物过程,功能组,富集分析,差异基因,植物激素,激素信号传导,糖代谢,苯基,丙烷,病原体,谷胱甘肽代谢,成花基因,ABA,酶基因,新基因,基因转录水平,分子遗传机制,转录组分析
AB值：
0.239153
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