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果生炭疽菌Rab蛋白家族鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
利用已报道的酿酒酵母的11个Rab蛋白氨基酸序列及Rab数据库对果生炭疽菌全基因组数据进行比对分析,共获得果生炭疽菌Rab蛋白10个.生物信息学分析表明:这10个Rab蛋白均不含信号肽和跨膜结构域,均为亲水蛋白.CfRab1和CfRab7蛋白定位于质膜,CfRab4蛋白定位于线粒体,其余7个Rab蛋白定位于高尔基体.该Rab蛋白家族均具有保守结构域,在丝状真菌中高度保守.实时荧光定量PCR结果表明,相对于菌丝阶段,CfRab5A和CfRabX1在孢子发育阶段表达量最高,CfRab1、CfRab2、CfRab4、CfRab5B、CfRab6、CfRab7和CfRab8在果生炭疽菌侵染后48 h表达量最高.研究为探究草莓果生炭疽菌Rab家族成员的功能奠定了基础.
文献关键词：
果生炭疽菌;Rab蛋白;生物信息学;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
张丽勍;安海山;方献平;李水根;张学英
作者机构：
上海市农业科学院林木果树研究所,上海市设施园艺技术重点实验室,上海201403
文献出处：
引用格式：
[1]张丽勍;安海山;方献平;李水根;张学英-.果生炭疽菌Rab蛋白家族鉴定及生物信息学分析)[J].上海农业学报,2022(05):37-46
A类：
CfRab1,CfRab7,CfRab4,CfRab5A,CfRabX1,CfRab2,CfRab5B,CfRab6,CfRab8
B类：
果生炭疽菌,白家,生物信息学分析,酿酒酵母,氨基酸序列,全基因组,基因组数据,比对分析,共获,信号肽,跨膜结构域,亲水,蛋白定位,质膜,高尔基体,保守结构域,丝状真菌,菌丝,孢子,发育阶段,侵染,草莓,进化分析
AB值：
0.181873
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