典型文献
某院2015-2019年肺炎克雷伯菌的耐药性及耐药基因分析
文献摘要：
目的 分析某院临床分离的肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)耐药情况及耐药基因,指导临床规范使用抗菌药物.方法 收集该院2015-2019年临床分离的2416株肺炎克雷伯菌,使用VITEK-2 Compact系统对临床分离株进行细菌鉴定,药敏试验采用MIC法和K-B纸片扩散法,采用WHONET 5.6软件对菌株的标本来源、科室分布、检出率及耐药率进行统计,采用SPSS 26.0软件对5年期间菌株的检出率、耐药率进行比较及趋势分析,选取2019年内科重症监护病房(Intensive care unit,ICU)的19株耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CR-KP),通过二代测序平台对其进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),运用丹麦技术大学(DTU)基因组流行病学中心(CGE)()的ResFinder 4.0工具进行耐药基因筛查,运用MORPHEUS()在线制作耐药基因热图.结果 2015-2019年临床标本共分离出2416株KP,主要来自痰液、尿液,分别占51.7％(1249/2416)、11.3％(273/2416),科室主要分布于内科ICU、外科ICU,分别占23.2％(561/2416)、19.1％(461/2416).每年KP的分离率呈上升趋势(x2趋势=18.190,P＜0.001),其对常用抗菌药物的耐药率呈逐年升高趋势,除对替加环素的耐药率无法统计外,对其他各类抗菌药物的耐药率差异均有统计学意义(P＜0.001),对亚胺培南、美罗培南耐药率分别从2015年的2.9％、3.0％上升至2019年的16.0％、13.7％.5年间共检出354株CR-KP,主要来自痰液、尿液,分别占43.8％(155/354)、10.7％(38/354),分布较高的科室为外科ICU、内科ICU,分别占14.4％(51/354)、10.2％(36/354),每年的检出率呈上升趋势(x2趋势=46.176,P＜0.001),其对各类抗菌药物的耐药率呈逐年升高趋势,除对庆大霉素的耐药率差异无统计学意义(P=0.105)、对替加环素的耐药率差异无法统计外,对其他各类抗菌药物的耐药率差异均有统计学意义(P＜0.05).采用WGS技术对19株CR-KP进行分析,共筛查出15种耐药基因,主要包括β-内酰胺酶耐药基因(blaKPC.2)、喹诺酮类耐药基因(qnrS1)、磷霉素耐药基因(fosA)、四环素耐药基因(tetA)、氯霉素耐药基因(catA2)以及氨基糖苷类耐药基因(aadA2b、rmtB)等.结论 该院KP、CR-KP的耐药情况日趋严重,CR-KP同时携带多种耐药基因,耐药表型多样化.运用WGS结合生物信息学分析技术研究细菌耐药机制,有助于耐药菌防控措施的精准实施,未来将成为耐药菌研究的主流技术之一.
文献关键词：
肺炎克雷伯菌;抗菌药物;全基因组测序;耐药基因
中图分类号：
作者姓名：
胡小骞;王琴
作者机构：
安徽医科大学第二附属医院,合肥230601
文献出处：
引用格式：
[1]胡小骞;王琴-.某院2015-2019年肺炎克雷伯菌的耐药性及耐药基因分析)[J].中国抗生素杂志,2022(07):711-718
A类：
MORPHEUS,catA2,aadA2b
B类：
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AB值：
0.322768
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