典型文献
1株多谱系毒株重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定和遗传变异分析
文献摘要:
从发病猪肺脏组织中检出猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV),将毒株命名为GXGG202007.对该毒株进行了病毒的分离以及全基因组测序、遗传演化分析和重组分析.结果显示GXGG202007毒株全基因组为15 517个核苷酸(nt);基于ORF5、nsp2和全基因组构建的系统发育树均显示该毒株处于谱系3分支;同源性分析表明其与QYYZ毒株的相似性最高(91.4%),与欧洲株Lelystad-virus(LV)相似性最低(60.3%);通过多种生物信息学软件的重组分析显示,该毒株存在4个重组事件,是1株以谱系3代表毒株QYYZ为骨架,谱系8毒株和谱系5毒株提供重组片段的多谱系重组毒株,其中与HP-PRRSV-like毒株和Resp-PRRS MLV-like毒株可能分别在42~2 008,6 884~8 549,13 061~13 853,8 550~9 523 nt处发生了重组,重组断点位于基因组的nsp2、nsp9和ORF3中.
文献关键词:
PRRSV;分离;重组;遗传演化分析
中图分类号:
作者姓名:
王新东;张康;庞燕丽;黄稳妃;莫清荣;黄静;陈樱;欧阳康;黄伟坚;韦祖樟
作者机构:
广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005;广西农业职业技术大学,动物科学技术系,广西南宁530007
文献出处:
引用格式:
[1]王新东;张康;庞燕丽;黄稳妃;莫清荣;黄静;陈樱;欧阳康;黄伟坚;韦祖樟-.1株多谱系毒株重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定和遗传变异分析)[J].中国兽医学报,2022(11):2164-2170,2180
A类:
GXGG202007,Lelystad,nsp9
B类:
株重,猪繁殖与呼吸综合征病毒,分离鉴定,遗传变异分析,病猪,肺脏,porcine,reproductive,respiratory,syndrome,virus,PRRSV,全基因组测序,遗传演化分析,重组分析,nt,ORF5,nsp2,组构,系统发育树,同源性分析,QYYZ,欧洲株,生物信息学软件,重组毒株,HP,like,Resp,MLV,断点,ORF3
AB值:
0.313099
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