以LysM(Pfam:PF01476)和Pkinase(Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果属(Malus spp.)及梨属(Pyrus spp.)植物基因组范围内鉴定了4个物种[苹果(M.pumila)'嘎啦'、山荆子(M.baccata)、杜梨(P.betulifolia)、白梨(Pyrus bretschneideri)'玉露香']的LysM-RLK家族成员,并对该家族成员的生物信息学和响应腐烂病菌(Valsa canker)信号的表达模式进行了分析.共获得37个LysM-RLK家族成员,主要定位于质膜;进化分析发现以上4个物种及拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的Ly-sM-RLK分为2个亚组;基因重复分析发现苹果和梨中都存在全基因组重复或片段重复现象,但仅苹果'嘎啦'中存在基因串联重复现象;该基因家族成员的启动子区域存在多个响应植物激素或逆境胁迫信号的元件;在腐烂病菌侵染后31个LysM-RLK成员存在差异表达,其中成员MD04G1238900、MD04G1238700、Chr9.g46389和Chr4.g40822(GDR数据库)表达量显著上调,可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因.

LysM-RLK;生物信息学;腐烂病菌;基因表达

王东东;温有福;赵丹;朵虎;王超;左存武

甘肃农业大学园艺学院,兰州730070;甘肃省静宁县林业和草原局,甘肃静宁743400;省部共建干旱生境作物学国家重点实验室,兰州730070

植物生理学报

[1]王东东;温有福;赵丹;朵虎;王超;左存武-.苹果和梨LysM-RLK响应腐烂病信号成员鉴定)[J].植物生理学报,2022(02):381-392

PF01476,Pkinase,PF00069,sM,全基因组重复,MD04G1238900,MD04G1238700,g46389,g40822

LysM,RLK,成员鉴定,Pfam,全蛋,子序列,苹果属,Malus,spp,Pyrus,植物基,pumila,嘎啦,山荆子,baccata,杜梨,betulifolia,白梨,bretschneideri,玉露,腐烂病菌,Valsa,canker,表达模式,共获,质膜,进化分析,拟南芥,Arabidopsis,thaliana,水稻,Oryza,sativa,复分析,复现,基因家族,启动子区域,植物激素,逆境胁迫,侵染,差异表达,Chr9,Chr4,GDR,功能分析,候选基因

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