典型文献
水稻ECT基因家族的全基因组研究
文献摘要：
真核生物mRNA转录后修饰可调控许多基因的遗传信息,植物m6A甲基化研究正成为关注的新热点.m6A结合蛋白(m6 A readers)调节m6 A修饰的特异性,通常具有YTH(YT521-B homology)结构域,在拟南芥中被命名为 ECT 结构域(evolutionarily conserved C-terminal region ECT domain).目前ECT基因已在拟南芥和水稻等植物中检测到,但该基因家族在水稻中的成员及生物学功能还缺乏研究.本研究通过水稻ECT基因家族的全基因组分析,鉴定出12个OsECT基因,具有1个保守的基序,多位于蛋白质氨基酸序列C-端.共线性分析表明,在水稻基因组内OsECT-c与OsECT-e发生了重复事件,在物种间ECT同源基因对可能是在双子叶和单子叶植物分化后形成.同源基因对OsECT的Ka/Ks＜1,表明OsECT基因家族在进化过程中可能经历了较强的纯化选择压力.表达模式分析显示,OsECT-b、OsECT-c、OsECT-e和OsECT-j在水稻生长初期各个组织均保持较高的表达水平,OsECT-g在干旱处理后表达量显著下调.因此,OsECT基因在水稻生长发育和逆境胁迫中可能发挥着重要作用.本研究为今后OsECT基因在水稻的节水抗旱机制研究和相关抗逆育种提供了重要的理论基础.
文献关键词：
水稻;m6A甲基化;YTH结构域;基因组共线性;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
宁德正;庄可卿;张巧玲;李华;张婉桐;张桁源;胡颂平;卫海滨
作者机构：
上海市农业生物基因中心,上海201106;江西农业大学生物科学与生物工程学院植物功能基因与组织培养技术研究中心,南昌330045;江西农业大学作物生理生态与江西农业大学遗传育种教育部重点实验室,南昌330045
文献出处：
引用格式：
[1]宁德正;庄可卿;张巧玲;李华;张婉桐;张桁源;胡颂平;卫海滨-.水稻ECT基因家族的全基因组研究)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(07):919-925
A类：
OsECT
B类：
基因家族,基因组研究,真核生物,后修饰,可调控,多基因,遗传信息,m6A,甲基化,结合蛋白,readers,YTH,YT521,homology,结构域,拟南芥,evolutionarily,conserved,terminal,region,domain,生物学功能,过水,全基因组分析,基序,氨基酸序列,共线性分析,种间,同源基因,双子叶,单子叶植物,Ka,Ks,选择压力,表达模式分析,水稻生长,旱处理,逆境胁迫,节水抗旱,抗旱机制,抗逆,育种,基因组共线性,表达分析
AB值：
0.317674
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