典型文献
新型分泌蛋白C6ORF120结构及功能的生物信息学分析
文献摘要:
目的:采用生物信息学方法预测C6ORF120蛋白的结构和生物学功能.方法:获取Genecards、Uniprot数据库中C6ORF120蛋白的FASTA序列,运用生物信息学工具分析C6ORF120蛋白的理化性质、亲水性/疏水性、二级结构、结构域、信号肽、跨膜区及其可能的生物学功能.结果:C6ORF120蛋白编码基因位于染色体6q27,主要存在于肝脏血液/免疫细胞的T细胞.C6ORF120蛋白是一个长度为191个氨基酸序列的分泌蛋白,属于亲水、不稳定的酸性蛋白质,大小为20.77 kD,在不同物种间呈高度保守.C6ORF120蛋白的信号肽位于1~31位氨基酸,不存在跨膜区,结构域位于7~191位氨基酸序列,属于UPF0669/pFam17065家族.C6ORF120蛋白的翻译后修饰有O-糖基化位点4个、N-糖基化位点1个、磷酸化位点16个,并且该蛋白与SDCBP、RNASET2等多种蛋白作用紧密,具有水解酶活性,可能参与多条糖脂分解代谢过程.结论:C6ORF120蛋白是亲水不稳定的分泌蛋白,可能在体内参与肝脏多种T细胞介导的生物学过程及肝脏相关疾病的免疫调节.
文献关键词:
分泌蛋白;C6ORF120;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
刘辉;吴苑妮;张瑞;韩晓旭;王玉琪;李鑫
作者机构:
首都医科大学附属北京地坛医院,北京100015;北京大学地坛医院教学医院,北京100015
文献出处:
引用格式:
[1]刘辉;吴苑妮;张瑞;韩晓旭;王玉琪;李鑫-.新型分泌蛋白C6ORF120结构及功能的生物信息学分析)[J].中国免疫学杂志,2022(16):1921-1926,1934
A类:
C6ORF120,FASTA,6q27,UPF0669,pFam17065,SDCBP,RNASET2
B类:
分泌蛋白,结构及功能,生物信息学分析,生物信息学方法,生物学功能,Genecards,Uniprot,生物信息学工具,亲水性,疏水性,二级结构,结构域,信号肽,蛋白编码,编码基因,免疫细胞,氨基酸序列,kD,种间,翻译后修饰,糖基化位点,磷酸化,种蛋,水解酶活性,多条,糖脂,分解代谢,代谢过程,内参,生物学过程,相关疾病,免疫调节
AB值:
0.239022
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